More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0346 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  100 
 
 
552 aa  1090    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  51.16 
 
 
566 aa  466  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  54.75 
 
 
517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  50.54 
 
 
533 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  46.04 
 
 
516 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  44.8 
 
 
531 aa  399  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  49.07 
 
 
502 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  46.5 
 
 
540 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  41.96 
 
 
490 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  42.35 
 
 
483 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  44.24 
 
 
557 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  43.64 
 
 
502 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  45.31 
 
 
487 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  43 
 
 
506 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  41.84 
 
 
483 aa  361  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  38.94 
 
 
660 aa  361  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  44.19 
 
 
486 aa  359  7e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  41.45 
 
 
520 aa  353  5e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  41.45 
 
 
520 aa  353  5e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  43.04 
 
 
607 aa  350  4e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  38.54 
 
 
509 aa  335  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  39.96 
 
 
522 aa  332  1e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  44.35 
 
 
481 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  43.22 
 
 
493 aa  322  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  46.28 
 
 
485 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  36.6 
 
 
572 aa  312  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  42.34 
 
 
596 aa  311  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  41.99 
 
 
486 aa  310  5e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  40.04 
 
 
513 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  40.08 
 
 
491 aa  300  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  39.34 
 
 
458 aa  294  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  40.26 
 
 
495 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  41.19 
 
 
509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  34.86 
 
 
478 aa  269  8e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  35.38 
 
 
536 aa  260  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  38.48 
 
 
522 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  36.04 
 
 
466 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  35.83 
 
 
466 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  35.83 
 
 
466 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  35.83 
 
 
466 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  35.38 
 
 
467 aa  236  9e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  34.5 
 
 
466 aa  229  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  35.42 
 
 
467 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  36.61 
 
 
464 aa  226  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  34.46 
 
 
463 aa  225  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  33.58 
 
 
466 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  35 
 
 
467 aa  224  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  35.39 
 
 
464 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  34.98 
 
 
465 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  33.06 
 
 
468 aa  219  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  33.89 
 
 
482 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  33.47 
 
 
473 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  33.2 
 
 
466 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  34.96 
 
 
456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  34.36 
 
 
487 aa  213  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  31.35 
 
 
455 aa  212  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  32.85 
 
 
474 aa  211  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  31.68 
 
 
531 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  33.13 
 
 
456 aa  210  5e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  32.48 
 
 
499 aa  209  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  31.85 
 
 
462 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  33.27 
 
 
453 aa  203  7e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  31.61 
 
 
456 aa  198  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  34.83 
 
 
462 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  33.47 
 
 
534 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  33.47 
 
 
534 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  33.47 
 
 
534 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  32.99 
 
 
543 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  32.78 
 
 
460 aa  194  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  31.19 
 
 
457 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  34 
 
 
456 aa  191  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  29.06 
 
 
498 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  33.54 
 
 
459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  33.33 
 
 
459 aa  174  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  29.09 
 
 
447 aa  172  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  31.62 
 
 
472 aa  162  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  32.55 
 
 
476 aa  161  4e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  27.42 
 
 
482 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  26.99 
 
 
467 aa  152  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  30.25 
 
 
471 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  30.07 
 
 
474 aa  150  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  26.19 
 
 
483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  29.64 
 
 
471 aa  147  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  26.19 
 
 
483 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  26.13 
 
 
446 aa  144  5e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  29.31 
 
 
482 aa  143  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  27.02 
 
 
482 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  27.35 
 
 
459 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  28.66 
 
 
472 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  28.68 
 
 
487 aa  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  30.88 
 
 
471 aa  137  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  29.78 
 
 
579 aa  137  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  26.29 
 
 
470 aa  135  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  27.29 
 
 
454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  28.44 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  27.23 
 
 
478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  33.78 
 
 
450 aa  127  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  26.75 
 
 
475 aa  126  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  25.29 
 
 
516 aa  124  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  24.65 
 
 
482 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>