More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2334 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  100 
 
 		 454 aa  884    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  67.7 
 
 		 450 aa  497  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  52.83 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  44.87 
 
 		 467 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  38.05 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  33.33 
 
 		 490 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  32.53 
 
 		 502 aa  216  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  32.27 
 
 		 483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  31.64 
 
 		 522 aa  206  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  33.26 
 
 		 487 aa  206  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  33.26 
 
 		 513 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  32.53 
 
 		 458 aa  203  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  33.72 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  33.93 
 
 		 557 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  32.8 
 
 		 520 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  32.8 
 
 		 520 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  32.69 
 
 		 531 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  30.68 
 
 		 466 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  29.63 
 
 		 607 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  33.1 
 
 		 483 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  35.46 
 
 		 486 aa  189  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  28.78 
 
 		 509 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  31.5 
 
 		 540 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  32.32 
 
 		 456 aa  186  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  28.45 
 
 		 572 aa  181  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  27.88 
 
 		 660 aa  180  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  29.66 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  30.77 
 
 		 506 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  35.88 
 
 		 485 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  32.57 
 
 		 491 aa  176  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  32.93 
 
 		 456 aa  176  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  30.86 
 
 		 516 aa  176  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  30.19 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  33.41 
 
 		 481 aa  173  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  29.62 
 
 		 566 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  32.94 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  30.79 
 
 		 596 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  31.75 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  29.5 
 
 		 482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  31.29 
 
 		 517 aa  167  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  26.76 
 
 		 552 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  31.54 
 
 		 487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  30.72 
 
 		 533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  28.44 
 
 		 466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  28.04 
 
 		 467 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  28.57 
 
 		 464 aa  162  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  28.04 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  27.96 
 
 		 466 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  28.44 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  28.44 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  28.44 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  27.96 
 
 		 466 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  31.79 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  31.07 
 
 		 486 aa  161  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  31.17 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  28.76 
 
 		 536 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  31.04 
 
 		 474 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  27.87 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  31.05 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  28.85 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  27.4 
 
 		 464 aa  156  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  30.88 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  28.64 
 
 		 456 aa  153  5e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  27.61 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  32.73 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  29.91 
 
 		 455 aa  150  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  29.14 
 
 		 534 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  29.14 
 
 		 534 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  29.14 
 
 		 534 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  25.85 
 
 		 531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  28.44 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  31.46 
 
 		 495 aa  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  30 
 
 		 522 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  29.06 
 
 		 487 aa  136  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  26.87 
 
 		 499 aa  136  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  28.74 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  28.29 
 
 		 543 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  28.86 
 
 		 502 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  28.9 
 
 		 459 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  30.03 
 
 		 474 aa  126  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  27.91 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  30.02 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  28.67 
 
 		 459 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  27.67 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  30.67 
 
 		 472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  26.76 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  25.55 
 
 		 447 aa  117  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  28.14 
 
 		 471 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  25.52 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  25.54 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  28.42 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  24.66 
 
 		 475 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  28.5 
 
 		 579 aa  109  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  25.12 
 
 		 482 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  23.9 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1152  citrate transporter  23.96 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0812794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  27.84 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  25.41 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  26.58 
 
 		 511 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  24.71 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>