More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0108 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  70.98 
 
 
456 aa  636    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  100 
 
 
462 aa  913    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  70.54 
 
 
456 aa  642    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  65.92 
 
 
457 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  59.74 
 
 
466 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  59.74 
 
 
466 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  59.1 
 
 
466 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  59.74 
 
 
466 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  59.09 
 
 
464 aa  534  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  61.8 
 
 
463 aa  532  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  58.64 
 
 
465 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  62.65 
 
 
466 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  59.35 
 
 
466 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  58.92 
 
 
467 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  58.71 
 
 
467 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  60.63 
 
 
464 aa  511  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  56.16 
 
 
459 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  56.16 
 
 
459 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  49.78 
 
 
462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  51.89 
 
 
453 aa  449  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  51.78 
 
 
455 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  50.77 
 
 
482 aa  437  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  52.22 
 
 
473 aa  435  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  49.89 
 
 
456 aa  433  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  52.55 
 
 
474 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  48.21 
 
 
460 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  48.03 
 
 
476 aa  365  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  39.95 
 
 
456 aa  332  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  50.77 
 
 
442 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  38.5 
 
 
483 aa  250  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  37.78 
 
 
483 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  36.75 
 
 
522 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  34.44 
 
 
458 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  33.19 
 
 
522 aa  218  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  32.27 
 
 
478 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  34.83 
 
 
552 aa  218  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  33.47 
 
 
536 aa  216  8e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  34.54 
 
 
502 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  38.62 
 
 
487 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  33.61 
 
 
660 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  36.41 
 
 
490 aa  208  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  33.63 
 
 
513 aa  208  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  35.87 
 
 
486 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  33.68 
 
 
509 aa  205  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  37.76 
 
 
506 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  33.41 
 
 
607 aa  202  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  33.6 
 
 
531 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  36.84 
 
 
486 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  33.41 
 
 
467 aa  196  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  32.4 
 
 
487 aa  195  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  35.26 
 
 
540 aa  193  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  33.83 
 
 
557 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  37.04 
 
 
509 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  34.69 
 
 
491 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  33.73 
 
 
468 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  33.18 
 
 
520 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  33.18 
 
 
520 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  36.02 
 
 
493 aa  187  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  37.58 
 
 
517 aa  182  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  32.37 
 
 
447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  32.52 
 
 
499 aa  180  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  36.57 
 
 
481 aa  176  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  32.81 
 
 
534 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  32.81 
 
 
534 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  33.48 
 
 
534 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  35.32 
 
 
516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  29.04 
 
 
531 aa  173  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  37.84 
 
 
485 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  37.2 
 
 
502 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  31.27 
 
 
533 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  30.29 
 
 
572 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  31.46 
 
 
482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  29.71 
 
 
467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  31.68 
 
 
570 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  33.33 
 
 
566 aa  161  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  30.66 
 
 
543 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  28.38 
 
 
446 aa  160  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  31.7 
 
 
450 aa  160  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  30.81 
 
 
466 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  29.45 
 
 
491 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  36.6 
 
 
495 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  31.19 
 
 
487 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  31.52 
 
 
454 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  29.45 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  30.73 
 
 
482 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  33.42 
 
 
472 aa  146  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  27.45 
 
 
498 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  31.15 
 
 
472 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  27.29 
 
 
475 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  28.9 
 
 
448 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  29.11 
 
 
483 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  29.07 
 
 
474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  26.24 
 
 
459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  27.93 
 
 
482 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  32.11 
 
 
471 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  32.81 
 
 
511 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  31.28 
 
 
471 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  31.7 
 
 
579 aa  135  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  27.49 
 
 
483 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  27.62 
 
 
516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>