More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4829 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  74.91 
 
 
534 aa  706    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  74.91 
 
 
534 aa  706    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  100 
 
 
543 aa  1047    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  74.91 
 
 
534 aa  706    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  56.37 
 
 
531 aa  566  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  40.8 
 
 
499 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  34.67 
 
 
487 aa  265  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  35.46 
 
 
502 aa  238  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  34.7 
 
 
522 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  33.67 
 
 
522 aa  227  4e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  32.36 
 
 
531 aa  224  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  34.91 
 
 
607 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  34.97 
 
 
513 aa  217  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  33 
 
 
490 aa  211  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  34.02 
 
 
660 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  33.2 
 
 
552 aa  205  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  33 
 
 
516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  33.47 
 
 
486 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  34.01 
 
 
540 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  32.83 
 
 
533 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  33.84 
 
 
487 aa  194  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  31.63 
 
 
557 aa  190  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  32.49 
 
 
491 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  30.02 
 
 
483 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  30.89 
 
 
566 aa  186  9e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  32.45 
 
 
509 aa  186  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  33.7 
 
 
517 aa  182  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  33.54 
 
 
465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  31.03 
 
 
536 aa  179  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  30.23 
 
 
520 aa  178  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  30.23 
 
 
520 aa  178  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  30.82 
 
 
467 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  30.8 
 
 
493 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  31.36 
 
 
509 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  30.94 
 
 
458 aa  177  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  30.48 
 
 
572 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  30.74 
 
 
478 aa  173  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  33.55 
 
 
463 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  32.34 
 
 
466 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  32.73 
 
 
466 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  32.73 
 
 
466 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  31.94 
 
 
466 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  32.89 
 
 
464 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  32.47 
 
 
486 aa  170  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  30.72 
 
 
464 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  34.25 
 
 
456 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  33.07 
 
 
467 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  33.07 
 
 
467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  33.61 
 
 
466 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  32.43 
 
 
474 aa  167  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  31.92 
 
 
457 aa  166  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  32.77 
 
 
466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  30.11 
 
 
482 aa  164  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  30.85 
 
 
483 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  33.05 
 
 
456 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  31.98 
 
 
473 aa  160  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  34.35 
 
 
485 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  29.72 
 
 
498 aa  159  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  33.67 
 
 
502 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  30.33 
 
 
495 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  29.76 
 
 
506 aa  156  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  31.68 
 
 
456 aa  156  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  31.91 
 
 
481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  28.02 
 
 
489 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  29.55 
 
 
456 aa  154  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  31.29 
 
 
596 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  30.74 
 
 
455 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  30.66 
 
 
462 aa  149  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  29.31 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  27.92 
 
 
453 aa  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  30.15 
 
 
468 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  30.96 
 
 
466 aa  143  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  25.79 
 
 
459 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  30.06 
 
 
476 aa  138  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  27.5 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  26.18 
 
 
446 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  29.36 
 
 
460 aa  130  8.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  27.6 
 
 
475 aa  130  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  26.45 
 
 
452 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  29.13 
 
 
482 aa  127  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  27.46 
 
 
516 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  27.13 
 
 
507 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  26.13 
 
 
487 aa  123  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  28.16 
 
 
526 aa  123  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  28.57 
 
 
450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  27.61 
 
 
482 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  25.26 
 
 
489 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  25.65 
 
 
518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  24.37 
 
 
470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  28.47 
 
 
474 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  27.05 
 
 
570 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  27.35 
 
 
483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  27.54 
 
 
472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  28.6 
 
 
459 aa  114  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  28.82 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  26.57 
 
 
482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  29.2 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  26.13 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  23.98 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  26.58 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>