More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0948 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  100 
 
 
509 aa  970    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  56.56 
 
 
493 aa  435  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  59.5 
 
 
495 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  55.51 
 
 
486 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  45.26 
 
 
483 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  49.6 
 
 
487 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  48.97 
 
 
490 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  46.34 
 
 
483 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  48.92 
 
 
486 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  43.39 
 
 
506 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  41.34 
 
 
552 aa  343  4e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  42.86 
 
 
557 aa  342  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  46.82 
 
 
491 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  47.13 
 
 
481 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  45.24 
 
 
516 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  42.27 
 
 
509 aa  323  3e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  46.27 
 
 
517 aa  322  9.999999999999999e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  43.57 
 
 
533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  42.49 
 
 
566 aa  320  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  41.65 
 
 
531 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  49.57 
 
 
485 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  40.35 
 
 
660 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  42.31 
 
 
540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  37.98 
 
 
522 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  41.08 
 
 
607 aa  306  8.000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  38.8 
 
 
502 aa  298  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  38.79 
 
 
520 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  38.79 
 
 
520 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  44.4 
 
 
502 aa  286  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  37.68 
 
 
458 aa  279  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  39.29 
 
 
466 aa  273  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  36.3 
 
 
478 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  38.32 
 
 
513 aa  269  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  38.75 
 
 
467 aa  262  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  39.25 
 
 
468 aa  258  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  42.36 
 
 
596 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  33.97 
 
 
487 aa  251  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  35.38 
 
 
456 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  39.75 
 
 
522 aa  243  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  37.86 
 
 
482 aa  239  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  33.4 
 
 
572 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  36.67 
 
 
474 aa  231  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  36.64 
 
 
473 aa  230  4e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  35.76 
 
 
536 aa  229  7e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  38.37 
 
 
456 aa  228  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  39.05 
 
 
456 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  36.69 
 
 
457 aa  225  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  35.39 
 
 
453 aa  223  8e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  34.21 
 
 
462 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  33.33 
 
 
463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  34.61 
 
 
464 aa  216  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  33.89 
 
 
465 aa  216  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  34.68 
 
 
455 aa  213  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  34.58 
 
 
466 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  35.81 
 
 
466 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  35.81 
 
 
466 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  34.7 
 
 
464 aa  211  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  32.22 
 
 
531 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  35.59 
 
 
466 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  34.08 
 
 
456 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  35.52 
 
 
466 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  37.04 
 
 
462 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  32.44 
 
 
543 aa  206  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  34.22 
 
 
466 aa  203  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  32.14 
 
 
534 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  32.08 
 
 
534 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  32.08 
 
 
534 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  34.14 
 
 
476 aa  200  6e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  33.84 
 
 
467 aa  200  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  33.84 
 
 
467 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  30.62 
 
 
447 aa  192  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  32.1 
 
 
499 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  34.66 
 
 
460 aa  190  5e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  35.45 
 
 
459 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  35.05 
 
 
472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  35.31 
 
 
459 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  30.11 
 
 
491 aa  173  5.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  29.62 
 
 
498 aa  170  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  29.95 
 
 
467 aa  169  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  32.05 
 
 
454 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  27.8 
 
 
516 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  32.11 
 
 
471 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  31.25 
 
 
482 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  30.47 
 
 
471 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  28.29 
 
 
459 aa  160  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  28.96 
 
 
570 aa  159  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  29.83 
 
 
482 aa  158  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  28.07 
 
 
487 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  39.27 
 
 
442 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  27.67 
 
 
446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  30.09 
 
 
450 aa  157  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  28.72 
 
 
472 aa  156  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  29.22 
 
 
478 aa  154  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  33.33 
 
 
471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  28.98 
 
 
482 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  27.61 
 
 
474 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  28.41 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  29.62 
 
 
579 aa  147  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  28.86 
 
 
483 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  29.54 
 
 
483 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>