268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003586 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  84.32 
 
 		 474 aa  762    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  100 
 
 		 472 aa  935    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  83.19 
 
 		 487 aa  799    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  68.01 
 
 		 471 aa  606  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  67.78 
 
 		 472 aa  578  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  57.39 
 
 		 471 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  57.48 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  57.05 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  63.71 
 
 		 579 aa  470  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  46.93 
 
 		 491 aa  403  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  36.69 
 
 		 482 aa  253  6e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  36.77 
 
 		 511 aa  236  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  31.91 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  31.72 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  30.21 
 
 		 522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  31.03 
 
 		 466 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  31.03 
 
 		 466 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  30.88 
 
 		 466 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  30.88 
 
 		 466 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  31.34 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  32.14 
 
 		 487 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  32.73 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  31.85 
 
 		 466 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  31.42 
 
 		 607 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  30.13 
 
 		 482 aa  160  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  31.11 
 
 		 467 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  28.79 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  29.62 
 
 		 660 aa  156  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  31.97 
 
 		 474 aa  156  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  29.75 
 
 		 487 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  32.14 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  29.58 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  31.21 
 
 		 557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  31.34 
 
 		 513 aa  153  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  29.02 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  29.5 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00469  phosphate transport (Eurofung)  31 
 
 		 1113 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  30.51 
 
 		 455 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  28.84 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  31.51 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  32.23 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  29.75 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  30.11 
 
 		 531 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  27.58 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  28.98 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  33.92 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  32.1 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  27.13 
 
 		 456 aa  144  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  28.76 
 
 		 453 aa  143  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  28.82 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  28.66 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  30.11 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  28.66 
 
 		 552 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03570  phosphate transporter, putative  29.4 
 
 		 952 aa  140  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  30.82 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  28.36 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  30.02 
 
 		 491 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  29.77 
 
 		 516 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  27.59 
 
 		 572 aa  136  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  28.81 
 
 		 522 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  29.71 
 
 		 506 aa  136  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  28.89 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  31.39 
 
 		 478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83361  low-affinity phosphate transporter  29.06 
 
 		 837 aa  134  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  26.83 
 
 		 520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  26.83 
 
 		 520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  28.69 
 
 		 447 aa  133  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  31.96 
 
 		 485 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86239  phosphate permease  29.94 
 
 		 963 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.182724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  31.15 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  30.08 
 
 		 468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  28.33 
 
 		 596 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  31.39 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  29.49 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  30.45 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  30.56 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  29.1 
 
 		 570 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  30.63 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  28.57 
 
 		 476 aa  124  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  29.77 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  28.69 
 
 		 566 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  28.57 
 
 		 517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  30.5 
 
 		 509 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  29.14 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  25.8 
 
 		 482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  26.69 
 
 		 543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  28.19 
 
 		 531 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  24.18 
 
 		 475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  30.81 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  27.57 
 
 		 482 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  26.83 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  28.71 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  25.38 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  28.71 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  28.71 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  23.41 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  25.27 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  27.72 
 
 		 482 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  21.98 
 
 		 452 aa  99.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0794  sodium/sulphate symporter  24.49 
 
 		 490 aa  99  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000496756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>