238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0794 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  71.31 
 
 
491 aa  686    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0794  sodium/sulphate symporter  100 
 
 
490 aa  962    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000496756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  58.46 
 
 
483 aa  541  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  53.14 
 
 
482 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  26.93 
 
 
446 aa  157  6e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  27.78 
 
 
482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  26.89 
 
 
459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  27.46 
 
 
482 aa  128  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  25.71 
 
 
452 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  26.07 
 
 
475 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  26.73 
 
 
483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  25.67 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  27.77 
 
 
466 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  26.34 
 
 
483 aa  117  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  27.77 
 
 
466 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  22.9 
 
 
531 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  27.46 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  27.47 
 
 
534 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  25.37 
 
 
522 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  26.93 
 
 
470 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  27.14 
 
 
466 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  26.73 
 
 
467 aa  114  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  25.69 
 
 
463 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  26.73 
 
 
467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2041  sodium/sulphate symporter  25 
 
 
488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341922  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  26.25 
 
 
466 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  25.2 
 
 
464 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  26.26 
 
 
456 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  27.37 
 
 
466 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  24.29 
 
 
460 aa  107  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  23.98 
 
 
487 aa  107  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  26.29 
 
 
464 aa  103  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  23.93 
 
 
522 aa  103  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  24.36 
 
 
493 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  24.03 
 
 
498 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  23.58 
 
 
462 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  25 
 
 
552 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  23.49 
 
 
516 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  25.28 
 
 
487 aa  101  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  23.45 
 
 
456 aa  100  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1347  response regulator receiver protein  25.63 
 
 
688 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  24.89 
 
 
491 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  24.88 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  25.42 
 
 
540 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  25.24 
 
 
486 aa  99  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  24.49 
 
 
472 aa  99  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  23.97 
 
 
607 aa  97.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  24.94 
 
 
491 aa  96.7  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  24.5 
 
 
660 aa  96.7  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  23.67 
 
 
509 aa  96.3  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  24.53 
 
 
502 aa  95.9  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  26.62 
 
 
499 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  24.25 
 
 
557 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  24.32 
 
 
457 aa  93.6  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  25.84 
 
 
495 aa  94  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  24.04 
 
 
520 aa  93.2  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  24.04 
 
 
520 aa  93.2  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  23.82 
 
 
491 aa  93.2  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  24.74 
 
 
461 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  27.51 
 
 
526 aa  92.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  22.87 
 
 
490 aa  92.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  24.09 
 
 
483 aa  91.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  24.48 
 
 
513 aa  91.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  23.96 
 
 
572 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  24.89 
 
 
486 aa  90.9  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  23.67 
 
 
506 aa  90.1  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  27.55 
 
 
489 aa  90.1  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  22.81 
 
 
483 aa  90.1  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  23.22 
 
 
482 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  24.44 
 
 
507 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  21.91 
 
 
531 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  26.7 
 
 
502 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  27.62 
 
 
517 aa  87  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  27.62 
 
 
517 aa  87  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  23.45 
 
 
455 aa  86.7  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  25.17 
 
 
618 aa  86.7  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  25 
 
 
491 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  23.27 
 
 
466 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  22.65 
 
 
493 aa  86.3  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  21.96 
 
 
536 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  24.89 
 
 
518 aa  85.1  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  22.49 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  24.58 
 
 
516 aa  84  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  23.82 
 
 
456 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  24.2 
 
 
566 aa  82.8  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  23.94 
 
 
447 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  24.84 
 
 
514 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  24.36 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  23.54 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  28.53 
 
 
570 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  24.01 
 
 
510 aa  80.9  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  23.83 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  25 
 
 
471 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  25.23 
 
 
517 aa  80.5  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  24.61 
 
 
474 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  24.31 
 
 
451 aa  79.7  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  25.38 
 
 
481 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  25.35 
 
 
485 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  22.94 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  27.53 
 
 
532 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>