More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2485 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  71.73 
 
 		 482 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  77.75 
 
 		 482 aa  770    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  96.69 
 
 		 483 aa  909    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  100 
 
 		 483 aa  960    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  40.27 
 
 		 459 aa  346  6e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  40.66 
 
 		 475 aa  336  5.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  36.56 
 
 		 446 aa  269  7e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  30.5 
 
 		 482 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  30 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  29.78 
 
 		 466 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  29.57 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  29.57 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  30.98 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  27.43 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  30.55 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  30.32 
 
 		 464 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  28.99 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  29.61 
 
 		 461 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  30.34 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  28.26 
 
 		 491 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  26.73 
 
 		 516 aa  156  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  29.44 
 
 		 467 aa  156  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  28.44 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  27.37 
 
 		 470 aa  154  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  28.57 
 
 		 522 aa  154  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  27.77 
 
 		 483 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  28.95 
 
 		 467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  28.89 
 
 		 607 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  28.85 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  26.3 
 
 		 487 aa  152  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  28.64 
 
 		 455 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  29.07 
 
 		 456 aa  150  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  26.19 
 
 		 552 aa  150  6e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  26.16 
 
 		 474 aa  149  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  26.71 
 
 		 520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  26.71 
 
 		 520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  25.96 
 
 		 456 aa  148  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  25.61 
 
 		 473 aa  146  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1872  sodium/sulphate symporter  27.68 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  27.71 
 
 		 660 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  28.87 
 
 		 486 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  26.87 
 
 		 498 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  27.08 
 
 		 536 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  28.63 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  28.03 
 
 		 531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  25.47 
 
 		 489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  27.23 
 
 		 493 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  27.97 
 
 		 456 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  27.86 
 
 		 618 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  26.91 
 
 		 531 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  26.59 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  28.89 
 
 		 513 aa  139  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  30.15 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  27.31 
 
 		 491 aa  137  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  27.29 
 
 		 557 aa  137  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  24.89 
 
 		 506 aa  137  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  28.21 
 
 		 522 aa  136  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  27.54 
 
 		 490 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  28.92 
 
 		 460 aa  136  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  25.44 
 
 		 482 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  26.17 
 
 		 483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  29.11 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  27.65 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  25.89 
 
 		 458 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  27.49 
 
 		 509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  26.38 
 
 		 422 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  26.38 
 
 		 422 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  26.38 
 
 		 422 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  27.31 
 
 		 483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  26.79 
 
 		 534 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  26.62 
 
 		 422 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  25.69 
 
 		 568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  28.54 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  26.86 
 
 		 534 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  26.86 
 
 		 534 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  26.86 
 
 		 534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  25.9 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  27.13 
 
 		 462 aa  126  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  28.39 
 
 		 566 aa  126  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  27.63 
 
 		 487 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  28.96 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  26.43 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  27 
 
 		 468 aa  124  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  27.09 
 
 		 543 aa  124  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  28.35 
 
 		 493 aa  123  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  29.17 
 
 		 472 aa  123  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  25 
 
 		 482 aa  123  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0794  sodium/sulphate symporter  26.73 
 
 		 490 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000496756  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  27.71 
 
 		 517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  29.08 
 
 		 509 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  26.38 
 
 		 540 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  24.36 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  25.83 
 
 		 516 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  30.19 
 
 		 495 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  25.93 
 
 		 499 aa  117  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  26.33 
 
 		 446 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  23.47 
 
 		 447 aa  116  8.999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  26.36 
 
 		 487 aa  114  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  23.96 
 
 		 533 aa  114  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  24.37 
 
 		 514 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>