285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00118 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  86 
 
 
478 aa  758    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  100 
 
 
471 aa  922    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  94.48 
 
 
471 aa  867    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  57.92 
 
 
487 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  57.48 
 
 
472 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  57.46 
 
 
474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  58.28 
 
 
471 aa  487  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  58.16 
 
 
472 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  56.06 
 
 
579 aa  385  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  45.32 
 
 
491 aa  383  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  37.47 
 
 
482 aa  264  3e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  37.55 
 
 
511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  29.57 
 
 
502 aa  169  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  29.61 
 
 
522 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  31.75 
 
 
457 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  29.26 
 
 
456 aa  157  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  32.21 
 
 
473 aa  156  9e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  28.49 
 
 
509 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  29.81 
 
 
520 aa  154  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  29.81 
 
 
520 aa  154  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  31.38 
 
 
474 aa  153  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  31.04 
 
 
483 aa  152  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  30.25 
 
 
552 aa  151  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83361  low-affinity phosphate transporter  30.61 
 
 
837 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  30.25 
 
 
482 aa  151  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  31.48 
 
 
487 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  30.61 
 
 
487 aa  149  9e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  31.33 
 
 
465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  29.94 
 
 
522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  30.92 
 
 
513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  26.81 
 
 
536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  30.18 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  30.18 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  30.11 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  29.8 
 
 
466 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  28.3 
 
 
557 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  28.18 
 
 
483 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  28.99 
 
 
466 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00469  phosphate transport (Eurofung)  30.83 
 
 
1113 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  31.18 
 
 
456 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  30.7 
 
 
467 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  30.75 
 
 
453 aa  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03570  phosphate transporter, putative  29.64 
 
 
952 aa  144  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626878  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  30.29 
 
 
460 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  30.32 
 
 
467 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  30.7 
 
 
467 aa  144  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  30.29 
 
 
466 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  30.58 
 
 
464 aa  142  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  31.44 
 
 
499 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  29.07 
 
 
531 aa  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  30.57 
 
 
456 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  29.76 
 
 
607 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  31.05 
 
 
478 aa  140  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  32.45 
 
 
486 aa  140  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  27.66 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  28.63 
 
 
490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  30.37 
 
 
455 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  30.34 
 
 
458 aa  136  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  30 
 
 
464 aa  136  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  26.95 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  30 
 
 
463 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  31.53 
 
 
517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  32.15 
 
 
486 aa  133  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  28.17 
 
 
531 aa  132  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  29.85 
 
 
491 aa  131  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  29.25 
 
 
506 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  27.51 
 
 
516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  29.49 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  29.49 
 
 
459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86239  phosphate permease  27.75 
 
 
963 aa  128  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.182724  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  27.9 
 
 
660 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  27.29 
 
 
572 aa  126  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  29.08 
 
 
481 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  27.66 
 
 
446 aa  124  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  31.28 
 
 
462 aa  123  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  31.13 
 
 
509 aa  123  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  27.88 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  27.4 
 
 
566 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  26.15 
 
 
447 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  26.86 
 
 
516 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  30.36 
 
 
485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  29.38 
 
 
502 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  31.59 
 
 
466 aa  116  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  26.52 
 
 
482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  27.83 
 
 
493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  25.11 
 
 
475 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  27.46 
 
 
543 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  27.52 
 
 
596 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  27.79 
 
 
459 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  25.23 
 
 
483 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  27.54 
 
 
498 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  24.56 
 
 
452 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  25.29 
 
 
449 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  28.88 
 
 
570 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  26.29 
 
 
447 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  24.19 
 
 
483 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  32.11 
 
 
495 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  27.99 
 
 
446 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  24.88 
 
 
448 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  27.81 
 
 
467 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>