231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1040 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  100 
 
 
467 aa  908    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  47.4 
 
 
447 aa  362  9e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  46.8 
 
 
450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  44.87 
 
 
454 aa  311  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  32.16 
 
 
483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  31.26 
 
 
487 aa  187  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  28.87 
 
 
483 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  29.03 
 
 
572 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  28.19 
 
 
502 aa  177  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  28.02 
 
 
607 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  32.38 
 
 
481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  28.68 
 
 
509 aa  172  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  32.22 
 
 
491 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  31.29 
 
 
540 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  30 
 
 
486 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  29.45 
 
 
506 aa  170  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  30.12 
 
 
458 aa  169  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  27.89 
 
 
660 aa  169  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  31.86 
 
 
467 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  29.45 
 
 
490 aa  163  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  28.04 
 
 
522 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  28.07 
 
 
466 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  29.16 
 
 
457 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  26.92 
 
 
531 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  29.41 
 
 
493 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  26.8 
 
 
552 aa  156  6e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  28.57 
 
 
478 aa  156  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  29.93 
 
 
462 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  27.97 
 
 
464 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  30.8 
 
 
487 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  29.27 
 
 
513 aa  152  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  28.39 
 
 
464 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  27.77 
 
 
517 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  26.53 
 
 
468 aa  150  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  28.51 
 
 
463 aa  150  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  27.95 
 
 
465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  28.7 
 
 
486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  28.87 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  27.92 
 
 
456 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  27.56 
 
 
466 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  28.85 
 
 
596 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  27.89 
 
 
466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  27.89 
 
 
466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  28.77 
 
 
459 aa  140  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  27.93 
 
 
467 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  27.67 
 
 
466 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  30.25 
 
 
509 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  27.79 
 
 
466 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  27.72 
 
 
467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  27.45 
 
 
466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  31.25 
 
 
485 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  28.94 
 
 
456 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  25.67 
 
 
536 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  27.27 
 
 
566 aa  136  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  29.78 
 
 
453 aa  134  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  28.38 
 
 
533 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  27.71 
 
 
462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  29.33 
 
 
516 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  28.93 
 
 
482 aa  133  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  25.93 
 
 
557 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  28.76 
 
 
482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  28.42 
 
 
495 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  29.67 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  29.42 
 
 
520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  29.42 
 
 
520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  29.04 
 
 
473 aa  126  9e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  26.79 
 
 
456 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  27.19 
 
 
531 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  26.83 
 
 
534 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  26.83 
 
 
534 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  26.83 
 
 
534 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  25.73 
 
 
455 aa  119  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  28.39 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  27.4 
 
 
491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  26.41 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  27.09 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  27.09 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  26.59 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  27.48 
 
 
502 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  28.84 
 
 
472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  27.1 
 
 
471 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  26.83 
 
 
471 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  26.21 
 
 
579 aa  106  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  26.67 
 
 
446 aa  104  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  29.81 
 
 
471 aa  105  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  29.29 
 
 
472 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  29.82 
 
 
474 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  28.51 
 
 
476 aa  101  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  25.23 
 
 
475 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  29.09 
 
 
487 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  24.06 
 
 
543 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  25.96 
 
 
478 aa  99.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  30.94 
 
 
499 aa  99  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  25.35 
 
 
482 aa  97.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  24.57 
 
 
483 aa  96.7  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  25.12 
 
 
483 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  26.63 
 
 
442 aa  93.2  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  24.77 
 
 
461 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  23.87 
 
 
517 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  23.87 
 
 
517 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>