More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2078 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  100 
 
 		 486 aa  922    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  50 
 
 		 506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  51.7 
 
 		 487 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  47.06 
 
 		 660 aa  412  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  44.92 
 
 		 483 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  48.99 
 
 		 607 aa  411  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  51.91 
 
 		 491 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  48.65 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  46.17 
 
 		 483 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  48.59 
 
 		 531 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  47.32 
 
 		 540 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  44.47 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  44.47 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  43.29 
 
 		 552 aa  383  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  44.07 
 
 		 502 aa  372  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  51.54 
 
 		 493 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  53.42 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  50.33 
 
 		 533 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  41.48 
 
 		 522 aa  364  2e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  45.47 
 
 		 557 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  43.79 
 
 		 516 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  50.31 
 
 		 486 aa  356  5e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  49.02 
 
 		 517 aa  354  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  46.55 
 
 		 566 aa  354  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  43.82 
 
 		 509 aa  353  2.9999999999999997e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  47.98 
 
 		 596 aa  350  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  50.21 
 
 		 502 aa  343  5e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  49.68 
 
 		 481 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  51.56 
 
 		 485 aa  335  9e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  40.72 
 
 		 458 aa  333  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  41.92 
 
 		 513 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  48.72 
 
 		 509 aa  324  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  40.68 
 
 		 478 aa  315  8e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  39.11 
 
 		 572 aa  313  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  40.8 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  40.43 
 
 		 466 aa  291  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  36.83 
 
 		 536 aa  282  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  38.12 
 
 		 468 aa  272  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  39.01 
 
 		 522 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  32.56 
 
 		 487 aa  242  7.999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  34.85 
 
 		 531 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  37.7 
 
 		 455 aa  240  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  34.94 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  35.96 
 
 		 499 aa  230  4e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  35.94 
 
 		 453 aa  229  7e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  36.51 
 
 		 465 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  36.66 
 
 		 457 aa  226  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  35.76 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  36.22 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  36.22 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  36.78 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  35.93 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  35.76 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  35.94 
 
 		 466 aa  224  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  36.96 
 
 		 463 aa  224  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  31.11 
 
 		 456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  34.98 
 
 		 456 aa  223  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  36.16 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  35.47 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  34.99 
 
 		 464 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  35.28 
 
 		 464 aa  221  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  35.47 
 
 		 467 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  36.57 
 
 		 473 aa  216  9e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  35.32 
 
 		 460 aa  215  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  35.79 
 
 		 456 aa  213  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  36 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  36.41 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  35.51 
 
 		 447 aa  209  7e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  34.09 
 
 		 534 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  34.09 
 
 		 534 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  34.09 
 
 		 534 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  33.81 
 
 		 543 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  37.39 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  37.16 
 
 		 459 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  36.77 
 
 		 476 aa  189  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  30.3 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  33.57 
 
 		 450 aa  181  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  29.1 
 
 		 498 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  34.2 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  32.39 
 
 		 491 aa  167  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  33.85 
 
 		 472 aa  167  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  34.07 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  27.97 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  31.03 
 
 		 482 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  28.45 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  30.13 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  40.45 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  31.86 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  28.04 
 
 		 483 aa  153  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  26.44 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  27.8 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  32.43 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  28.26 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  31.38 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  29.74 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  31.09 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  29.83 
 
 		 570 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  28.44 
 
 		 482 aa  147  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  29.4 
 
 		 474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  28.8 
 
 		 472 aa  147  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>