256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2341 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  100 
 
 		 472 aa  925    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  76.91 
 
 		 471 aa  685    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  66.53 
 
 		 472 aa  631  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  66.6 
 
 		 487 aa  628  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  68.64 
 
 		 474 aa  618  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  56.83 
 
 		 471 aa  502  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  56.39 
 
 		 471 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  55.98 
 
 		 478 aa  485  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  59.16 
 
 		 579 aa  444  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  46.04 
 
 		 491 aa  423  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  38.36 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  36.47 
 
 		 511 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  31.86 
 
 		 552 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  31.16 
 
 		 522 aa  173  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  31.03 
 
 		 513 aa  170  7e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  30.34 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  31.21 
 
 		 557 aa  166  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  32.51 
 
 		 466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  32.28 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  32.28 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  28.85 
 
 		 502 aa  163  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  29.27 
 
 		 536 aa  163  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  32.05 
 
 		 466 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  32.05 
 
 		 466 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  34.49 
 
 		 457 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  29.92 
 
 		 509 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  34.04 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  30 
 
 		 520 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  30 
 
 		 520 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  33.18 
 
 		 456 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  33.1 
 
 		 486 aa  159  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  32.2 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  32.83 
 
 		 487 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  32.95 
 
 		 467 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  32.2 
 
 		 460 aa  156  7e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  33.26 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  31.9 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  30.04 
 
 		 487 aa  153  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  28.38 
 
 		 660 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  32.48 
 
 		 467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  30.85 
 
 		 483 aa  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  31.71 
 
 		 463 aa  153  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  32.24 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  31.77 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  31.52 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  30.02 
 
 		 531 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  29.49 
 
 		 540 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  31.97 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  32.59 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  29.1 
 
 		 607 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  29.35 
 
 		 490 aa  151  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  29.88 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  30.77 
 
 		 455 aa  150  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  30.51 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  28.12 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  31.17 
 
 		 516 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  34.75 
 
 		 509 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  31.02 
 
 		 506 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00469  phosphate transport (Eurofung)  30.54 
 
 		 1113 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  28.82 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  34.01 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  29.92 
 
 		 566 aa  141  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  30.16 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  29.12 
 
 		 522 aa  140  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83361  low-affinity phosphate transporter  28.99 
 
 		 837 aa  140  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  28.24 
 
 		 572 aa  139  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86239  phosphate permease  28.72 
 
 		 963 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.182724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  32.97 
 
 		 485 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  30.44 
 
 		 467 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  29.91 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  29 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  29.2 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  29.13 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  27.99 
 
 		 482 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  30.8 
 
 		 499 aa  127  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03570  phosphate transporter, putative  29.22 
 
 		 952 aa  126  9e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626878  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  30.94 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  28.51 
 
 		 596 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  28.51 
 
 		 491 aa  124  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  31.17 
 
 		 493 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  26.75 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  27.56 
 
 		 483 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  29.87 
 
 		 570 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  28.23 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  32.19 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  27.87 
 
 		 531 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  31.93 
 
 		 459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  27.13 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  28.54 
 
 		 491 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  27.5 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  27.93 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  29.87 
 
 		 502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  32.54 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  28.8 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  27.97 
 
 		 482 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  26.17 
 
 		 498 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  25.88 
 
 		 543 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  26.34 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  23.92 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  28.34 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.894834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>