More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0150 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  100 
 
 
531 aa  1031    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  57.12 
 
 
543 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  57.52 
 
 
534 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  57.52 
 
 
534 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  57.52 
 
 
534 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  42.13 
 
 
499 aa  356  6.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  38.56 
 
 
522 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  32.49 
 
 
487 aa  252  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  34.61 
 
 
660 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  35.94 
 
 
502 aa  246  8e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  35.48 
 
 
607 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  33.33 
 
 
531 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  32.8 
 
 
522 aa  238  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  33.07 
 
 
490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  34.92 
 
 
486 aa  230  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  32.05 
 
 
516 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  33.07 
 
 
483 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  31.96 
 
 
552 aa  224  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  35.92 
 
 
513 aa  221  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  33.72 
 
 
533 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  32.58 
 
 
540 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  32.86 
 
 
557 aa  212  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  31.87 
 
 
566 aa  211  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  33.47 
 
 
491 aa  210  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  33.33 
 
 
493 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  32.11 
 
 
487 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  33.19 
 
 
517 aa  204  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  33.53 
 
 
596 aa  202  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  32.7 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  36.16 
 
 
502 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  32.18 
 
 
520 aa  200  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  32.18 
 
 
520 aa  200  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  33.81 
 
 
495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  31.6 
 
 
506 aa  197  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  32.34 
 
 
458 aa  196  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  31.67 
 
 
509 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  34.79 
 
 
486 aa  195  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  34.04 
 
 
467 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  29.06 
 
 
498 aa  194  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  31.46 
 
 
483 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  30.06 
 
 
463 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  31.08 
 
 
453 aa  190  5.999999999999999e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  33.07 
 
 
481 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  29.86 
 
 
572 aa  187  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  30.35 
 
 
465 aa  186  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  31.8 
 
 
509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  32 
 
 
482 aa  182  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  31.06 
 
 
536 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  27.92 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  35.84 
 
 
485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  31.29 
 
 
456 aa  181  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  31.99 
 
 
474 aa  179  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  31.99 
 
 
468 aa  178  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  32.83 
 
 
473 aa  177  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  31.25 
 
 
466 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  30.25 
 
 
462 aa  176  7e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  29.56 
 
 
478 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  30.78 
 
 
466 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  31.05 
 
 
466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  30.22 
 
 
456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  30.91 
 
 
457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  30.85 
 
 
466 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  30.85 
 
 
466 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  32.26 
 
 
466 aa  174  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  29.41 
 
 
464 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  30.18 
 
 
467 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  30.18 
 
 
467 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  28.68 
 
 
489 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  29.59 
 
 
466 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  30.06 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  30.3 
 
 
460 aa  164  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  29.44 
 
 
462 aa  162  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  25.21 
 
 
456 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  31.56 
 
 
459 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  27.48 
 
 
447 aa  154  5e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  29.22 
 
 
510 aa  153  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  31.56 
 
 
459 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  27.66 
 
 
452 aa  150  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  31.12 
 
 
476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  27.2 
 
 
450 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  25.58 
 
 
459 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  26.03 
 
 
475 aa  144  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  28.63 
 
 
478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  28.49 
 
 
471 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  29.41 
 
 
471 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  26.07 
 
 
516 aa  134  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  25.44 
 
 
446 aa  134  6e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  24.62 
 
 
489 aa  133  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  29.38 
 
 
482 aa  133  9e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  26.77 
 
 
482 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  24.84 
 
 
454 aa  130  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  26.46 
 
 
507 aa  130  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  28.34 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  28.69 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  27.4 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  28.09 
 
 
491 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  26.85 
 
 
483 aa  127  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  27.19 
 
 
483 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  27.79 
 
 
514 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  28.6 
 
 
505 aa  125  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>