More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01988 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  100 
 
 
478 aa  947    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  57.27 
 
 
458 aa  487  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  51.97 
 
 
467 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  40.53 
 
 
490 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  40 
 
 
502 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  40.72 
 
 
486 aa  299  7e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  40.13 
 
 
522 aa  296  5e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  39.88 
 
 
660 aa  292  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  39.74 
 
 
520 aa  283  7.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  39.74 
 
 
520 aa  283  7.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  38.98 
 
 
607 aa  282  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  40.18 
 
 
487 aa  272  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  34.5 
 
 
552 aa  271  2e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  37.01 
 
 
509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  38.31 
 
 
506 aa  269  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  38.46 
 
 
531 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  39.91 
 
 
513 aa  261  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  40.45 
 
 
491 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  35.01 
 
 
572 aa  259  8e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  36.47 
 
 
483 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  36.79 
 
 
557 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  38.16 
 
 
540 aa  256  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  34.64 
 
 
566 aa  249  8e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  37.26 
 
 
533 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  35.99 
 
 
596 aa  249  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  37.85 
 
 
468 aa  247  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  39.64 
 
 
481 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  39.2 
 
 
516 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  35.92 
 
 
466 aa  233  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  37.36 
 
 
493 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  37.47 
 
 
483 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  36.7 
 
 
486 aa  229  9e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  36.38 
 
 
509 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  37.2 
 
 
517 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  41.44 
 
 
485 aa  223  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  35.07 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  35.9 
 
 
456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  34.49 
 
 
466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  34.83 
 
 
466 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  35.46 
 
 
466 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  35.46 
 
 
466 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  34.91 
 
 
465 aa  217  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  35.24 
 
 
466 aa  217  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  34.99 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  35.95 
 
 
495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  33.41 
 
 
447 aa  212  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  38.08 
 
 
502 aa  209  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  34.62 
 
 
473 aa  209  9e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  33.94 
 
 
474 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  35.28 
 
 
522 aa  207  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  34.28 
 
 
467 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  34.32 
 
 
463 aa  207  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  35.03 
 
 
456 aa  206  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  34.15 
 
 
467 aa  206  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  35.55 
 
 
466 aa  206  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  34.53 
 
 
460 aa  202  9e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  35.31 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  35.37 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  30.21 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  32.16 
 
 
464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  33.79 
 
 
464 aa  199  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  30.81 
 
 
536 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  34.75 
 
 
456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  31.95 
 
 
462 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  34.69 
 
 
462 aa  192  9e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  34.19 
 
 
534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  33.76 
 
 
534 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  33.76 
 
 
534 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  31.14 
 
 
487 aa  186  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  33.41 
 
 
459 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  33.41 
 
 
459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  32.34 
 
 
454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  31.97 
 
 
450 aa  173  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  29.37 
 
 
531 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  31.03 
 
 
543 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  33.47 
 
 
476 aa  169  9e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  32.11 
 
 
499 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  28.5 
 
 
467 aa  153  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  35.58 
 
 
442 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  28.86 
 
 
498 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  30.12 
 
 
478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  30.41 
 
 
471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  31.4 
 
 
472 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  30.51 
 
 
487 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  30.21 
 
 
471 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  30.13 
 
 
474 aa  133  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  26.61 
 
 
459 aa  133  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  28.5 
 
 
446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  29.48 
 
 
446 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  29.24 
 
 
461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  26.26 
 
 
475 aa  126  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  30.29 
 
 
472 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  27.84 
 
 
447 aa  124  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1152  citrate transporter  29.23 
 
 
446 aa  123  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0812794  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  24.89 
 
 
482 aa  123  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  24.88 
 
 
482 aa  123  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  29.85 
 
 
579 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1523  citrate transporter  29.83 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  26.45 
 
 
449 aa  118  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  26.62 
 
 
491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>