More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1510 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  100 
 
 
522 aa  1027    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  58.05 
 
 
513 aa  589  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  59.07 
 
 
502 aa  568  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  45.16 
 
 
490 aa  391  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  44.12 
 
 
531 aa  385  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  43.18 
 
 
660 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  42.12 
 
 
607 aa  361  2e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  42.24 
 
 
487 aa  339  7e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  42.24 
 
 
557 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  41.48 
 
 
486 aa  335  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  39.96 
 
 
552 aa  332  1e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  41.89 
 
 
520 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  41.89 
 
 
520 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  40.88 
 
 
540 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  39.38 
 
 
483 aa  324  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  39.73 
 
 
506 aa  323  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  42.29 
 
 
491 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  42.63 
 
 
458 aa  317  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  41.09 
 
 
596 aa  314  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  40.49 
 
 
483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  38.72 
 
 
572 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  41.68 
 
 
517 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  41.63 
 
 
509 aa  307  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  39.85 
 
 
533 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  41.28 
 
 
486 aa  301  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  43.66 
 
 
502 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  37.82 
 
 
566 aa  296  6e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  40.31 
 
 
478 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  41.4 
 
 
516 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  41.24 
 
 
481 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  42.52 
 
 
485 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  39.5 
 
 
493 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  41.18 
 
 
467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  37.38 
 
 
522 aa  270  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  42.07 
 
 
495 aa  266  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  37.78 
 
 
509 aa  250  5e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  35.6 
 
 
536 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  36.62 
 
 
455 aa  234  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  35.06 
 
 
466 aa  233  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  36.29 
 
 
462 aa  233  6e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  32.93 
 
 
531 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  36.34 
 
 
456 aa  231  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  34.46 
 
 
468 aa  227  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  35.29 
 
 
456 aa  226  7e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  35.26 
 
 
464 aa  224  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  31.45 
 
 
487 aa  223  7e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  33.47 
 
 
543 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  34.41 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  33.86 
 
 
466 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  33.66 
 
 
466 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  35.5 
 
 
456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  36.14 
 
 
447 aa  217  4e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  34.03 
 
 
463 aa  217  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  34.02 
 
 
466 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  34.02 
 
 
466 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  34.84 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  33.62 
 
 
466 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  32.04 
 
 
465 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  35.27 
 
 
474 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  32.69 
 
 
534 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  32.69 
 
 
534 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  32.9 
 
 
534 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  33.75 
 
 
467 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  33.54 
 
 
467 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  32.05 
 
 
473 aa  209  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  32.92 
 
 
466 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  33.91 
 
 
457 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  34.01 
 
 
499 aa  206  9e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  33.11 
 
 
482 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  31.3 
 
 
456 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  32.83 
 
 
460 aa  193  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  31.32 
 
 
462 aa  190  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  31.35 
 
 
459 aa  187  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  31.13 
 
 
459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  31.64 
 
 
454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  32.08 
 
 
450 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  30 
 
 
475 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  29.37 
 
 
487 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  30.92 
 
 
482 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  29.03 
 
 
474 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  30.21 
 
 
472 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  27.84 
 
 
498 aa  162  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  31.15 
 
 
472 aa  160  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  28.04 
 
 
467 aa  159  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  29.42 
 
 
471 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  29.39 
 
 
471 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  31.79 
 
 
476 aa  155  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  33.5 
 
 
579 aa  152  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  31.73 
 
 
471 aa  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  31.14 
 
 
442 aa  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  28.92 
 
 
478 aa  150  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  28.41 
 
 
459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  27.98 
 
 
482 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  28.81 
 
 
482 aa  147  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  27 
 
 
483 aa  144  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  29.28 
 
 
446 aa  143  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  27.57 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  28.34 
 
 
570 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  29.08 
 
 
483 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  25 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>