More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2574 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  74.91 
 
 
543 aa  732    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  100 
 
 
534 aa  1035    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  100 
 
 
534 aa  1035    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  99.81 
 
 
534 aa  1033    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  57.52 
 
 
531 aa  588  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  43.51 
 
 
499 aa  355  1e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  34.97 
 
 
487 aa  268  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  31.91 
 
 
531 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  35.25 
 
 
660 aa  242  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  34.53 
 
 
502 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  35.94 
 
 
607 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  32.53 
 
 
522 aa  238  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  33.67 
 
 
522 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  32.79 
 
 
483 aa  229  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  32.73 
 
 
490 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  34.52 
 
 
513 aa  225  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  33.13 
 
 
557 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  33.88 
 
 
566 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  33.47 
 
 
552 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  34.58 
 
 
516 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  35.21 
 
 
540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  33.33 
 
 
493 aa  217  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  33.94 
 
 
491 aa  217  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  33.82 
 
 
486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  32.76 
 
 
520 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  32.76 
 
 
520 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  33.2 
 
 
487 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  36.73 
 
 
517 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  33.46 
 
 
533 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  34.18 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  36.81 
 
 
502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  34.06 
 
 
478 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  34.49 
 
 
456 aa  200  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  31.35 
 
 
572 aa  198  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  31.88 
 
 
509 aa  197  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  32.64 
 
 
465 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  33.82 
 
 
486 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  32.32 
 
 
467 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  33.61 
 
 
457 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  29.77 
 
 
483 aa  192  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  32.21 
 
 
466 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  32.21 
 
 
466 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  32.3 
 
 
464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  32.71 
 
 
596 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  32.65 
 
 
495 aa  191  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  33.62 
 
 
463 aa  191  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  32.66 
 
 
466 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  32.21 
 
 
466 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  31.82 
 
 
506 aa  189  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  32.15 
 
 
455 aa  189  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  33.12 
 
 
466 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  31.69 
 
 
509 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  31.65 
 
 
462 aa  187  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  32.73 
 
 
464 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  31.84 
 
 
458 aa  187  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  31.85 
 
 
453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  32.99 
 
 
456 aa  184  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  33.26 
 
 
466 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  32.11 
 
 
467 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  32.11 
 
 
467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  32.27 
 
 
462 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  33.95 
 
 
481 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  28.74 
 
 
498 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  33.33 
 
 
485 aa  178  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  33.55 
 
 
474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  32.71 
 
 
536 aa  174  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  32.57 
 
 
460 aa  173  7.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  28.29 
 
 
456 aa  172  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  32.1 
 
 
473 aa  169  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  31.62 
 
 
482 aa  168  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  30.29 
 
 
466 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  34.15 
 
 
468 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  26 
 
 
459 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  30.23 
 
 
450 aa  157  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  28.46 
 
 
489 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  26.87 
 
 
470 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  28.6 
 
 
447 aa  150  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  30.97 
 
 
459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  28.12 
 
 
482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  30.97 
 
 
459 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  27.03 
 
 
475 aa  147  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  30.08 
 
 
476 aa  145  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  26.94 
 
 
452 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  28.54 
 
 
482 aa  139  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  27.29 
 
 
446 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  27.99 
 
 
454 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  27.45 
 
 
510 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  27.55 
 
 
478 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  26.86 
 
 
483 aa  131  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  27.05 
 
 
483 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  28.25 
 
 
570 aa  130  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  27.24 
 
 
507 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  26.46 
 
 
516 aa  127  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  24.67 
 
 
489 aa  125  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  28.85 
 
 
618 aa  123  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  26.94 
 
 
467 aa  123  8e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  26.4 
 
 
448 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  26.67 
 
 
482 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1347  response regulator receiver protein  28.73 
 
 
688 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  28.04 
 
 
493 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>