290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2238 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  100 
 
 
510 aa  996    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  97.07 
 
 
478 aa  896    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  50.73 
 
 
507 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  48.95 
 
 
518 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  47.17 
 
 
517 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  47.17 
 
 
517 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  49.28 
 
 
489 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  51.88 
 
 
451 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  47.94 
 
 
526 aa  395  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  44.21 
 
 
505 aa  345  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  31.22 
 
 
491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  30.08 
 
 
514 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  25.36 
 
 
489 aa  170  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  26.4 
 
 
493 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  27.25 
 
 
491 aa  157  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  29.27 
 
 
531 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  26.4 
 
 
533 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  26.81 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  25.15 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  23.75 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  25.64 
 
 
487 aa  134  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  27.66 
 
 
476 aa  134  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  26.51 
 
 
487 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  26.51 
 
 
487 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  26.36 
 
 
487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  26.1 
 
 
487 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  27.66 
 
 
568 aa  130  7.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  25.4 
 
 
498 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  26.92 
 
 
460 aa  126  8.000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  26.1 
 
 
487 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  26.1 
 
 
487 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  26.07 
 
 
473 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  25.71 
 
 
476 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  25.71 
 
 
476 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  26.1 
 
 
487 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  26.1 
 
 
487 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  26.1 
 
 
487 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  26.98 
 
 
476 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  26.1 
 
 
487 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  26.6 
 
 
463 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  27.59 
 
 
487 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  24.44 
 
 
446 aa  124  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  25.59 
 
 
466 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  24.9 
 
 
465 aa  123  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  25.99 
 
 
534 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  25.71 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  25.99 
 
 
534 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  25.2 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  25.2 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  25.39 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  25.78 
 
 
534 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  28.28 
 
 
456 aa  120  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  25.55 
 
 
522 aa  120  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  25 
 
 
470 aa  120  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  24.95 
 
 
483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  23.38 
 
 
452 aa  117  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  25.81 
 
 
464 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  24.43 
 
 
476 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  28.2 
 
 
540 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  27.57 
 
 
456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  25.46 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  24.4 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  24.52 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  28.35 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  27.03 
 
 
475 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  24.21 
 
 
467 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  27.03 
 
 
475 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  25.76 
 
 
607 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  28.06 
 
 
522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  27.03 
 
 
475 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  25.99 
 
 
464 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  25.22 
 
 
457 aa  114  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  26.71 
 
 
478 aa  113  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  24.56 
 
 
466 aa  113  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  22.32 
 
 
459 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  23.44 
 
 
485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  26.87 
 
 
557 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  25.3 
 
 
566 aa  110  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  24 
 
 
516 aa  110  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  25.22 
 
 
453 aa  109  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  25.98 
 
 
494 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  25.36 
 
 
483 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  23.82 
 
 
491 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  28.94 
 
 
472 aa  108  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  25 
 
 
509 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  26.33 
 
 
543 aa  107  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  26.64 
 
 
499 aa  106  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  25.92 
 
 
484 aa  106  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  24.58 
 
 
483 aa  104  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  24.9 
 
 
531 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  23.82 
 
 
462 aa  103  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  24.33 
 
 
475 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  26.41 
 
 
462 aa  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  23.61 
 
 
482 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  26.2 
 
 
502 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  25.64 
 
 
482 aa  102  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  26.71 
 
 
484 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  25.61 
 
 
502 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  25.39 
 
 
473 aa  101  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  25.21 
 
 
482 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>