208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0634 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  100 
 
 
487 aa  967    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  100 
 
 
487 aa  967    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  967    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  99.79 
 
 
476 aa  945    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  100 
 
 
487 aa  967    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  100 
 
 
487 aa  967    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  95.28 
 
 
487 aa  931    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  95.07 
 
 
487 aa  929    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  100 
 
 
487 aa  967    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  94.87 
 
 
487 aa  926    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  94.66 
 
 
487 aa  925    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  97.06 
 
 
476 aa  925    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  80.45 
 
 
487 aa  781    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  50.63 
 
 
483 aa  487  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  50.64 
 
 
502 aa  481  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  49.78 
 
 
506 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  45.01 
 
 
487 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  45.01 
 
 
487 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  45.01 
 
 
487 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  44.8 
 
 
487 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  44.8 
 
 
487 aa  438  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  44.8 
 
 
487 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  44.8 
 
 
487 aa  438  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  44.8 
 
 
487 aa  438  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  44.91 
 
 
481 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  40.85 
 
 
469 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  37.67 
 
 
472 aa  295  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  37.67 
 
 
472 aa  295  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  37.63 
 
 
466 aa  295  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  35.73 
 
 
472 aa  289  8e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  35.9 
 
 
517 aa  283  6.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  35.91 
 
 
501 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  33.4 
 
 
467 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  35.52 
 
 
473 aa  279  9e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  33.27 
 
 
488 aa  274  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  33.7 
 
 
492 aa  267  4e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  33.54 
 
 
476 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  34.47 
 
 
479 aa  262  8e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  34.17 
 
 
484 aa  260  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  33.47 
 
 
477 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  33.47 
 
 
477 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  33.47 
 
 
477 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  33.47 
 
 
477 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  33.47 
 
 
477 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  32.92 
 
 
484 aa  257  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  33.76 
 
 
484 aa  256  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  33.47 
 
 
475 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  33.47 
 
 
475 aa  256  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  33.26 
 
 
475 aa  256  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  34.07 
 
 
501 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  33.06 
 
 
477 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  33.4 
 
 
470 aa  253  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  32.99 
 
 
470 aa  250  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  31.59 
 
 
494 aa  249  9e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  34.82 
 
 
490 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  33.83 
 
 
501 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  33.83 
 
 
501 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  33.69 
 
 
478 aa  243  7e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  31.94 
 
 
490 aa  240  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  31.58 
 
 
470 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  32.46 
 
 
490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  30.77 
 
 
475 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  32.59 
 
 
489 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  33.04 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  31.5 
 
 
527 aa  216  9e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  35.05 
 
 
414 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  30.67 
 
 
473 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  30.43 
 
 
469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  29.55 
 
 
495 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  26.98 
 
 
478 aa  123  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  25.9 
 
 
510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  26.58 
 
 
493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  27.57 
 
 
507 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  26.77 
 
 
489 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  23.43 
 
 
489 aa  107  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  23.21 
 
 
517 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  23.21 
 
 
517 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  24.49 
 
 
518 aa  103  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  28.8 
 
 
526 aa  101  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  25.64 
 
 
459 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  26.83 
 
 
505 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  26.49 
 
 
543 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  24.4 
 
 
531 aa  94.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  23.64 
 
 
473 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  23.45 
 
 
476 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  23.45 
 
 
476 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  24.89 
 
 
491 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  26.06 
 
 
451 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  25.06 
 
 
516 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  22.55 
 
 
452 aa  88.6  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  25.67 
 
 
534 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  25.67 
 
 
534 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  26.03 
 
 
534 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  23.32 
 
 
536 aa  85.1  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  21.63 
 
 
476 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  23.38 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  22.91 
 
 
516 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  26.92 
 
 
482 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  24.7 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  26.35 
 
 
485 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>