211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3912 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  100 
 
 
483 aa  944    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  79.46 
 
 
502 aa  748    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  56.36 
 
 
487 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  56.36 
 
 
487 aa  530  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  56.36 
 
 
487 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  56.14 
 
 
487 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  56.14 
 
 
487 aa  528  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  56.14 
 
 
487 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  56.14 
 
 
487 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  56.14 
 
 
487 aa  528  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  51.26 
 
 
487 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  51.26 
 
 
487 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  50.63 
 
 
487 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  50.63 
 
 
487 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  50.63 
 
 
487 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  51.06 
 
 
476 aa  502  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  50.84 
 
 
487 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  50.63 
 
 
487 aa  502  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  50.63 
 
 
487 aa  502  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  50.63 
 
 
487 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  51.05 
 
 
487 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  50.64 
 
 
476 aa  500  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  50.85 
 
 
487 aa  495  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  55.06 
 
 
506 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  50 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  48.07 
 
 
481 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  36.13 
 
 
517 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  40.29 
 
 
472 aa  309  8e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  40.29 
 
 
472 aa  309  8e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  40.21 
 
 
473 aa  306  8.000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  37.74 
 
 
501 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  37.84 
 
 
472 aa  298  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  35.5 
 
 
466 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  36 
 
 
492 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  36.71 
 
 
501 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  35.95 
 
 
484 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  34.45 
 
 
476 aa  280  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  38.36 
 
 
484 aa  280  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  37.5 
 
 
484 aa  280  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  34.73 
 
 
488 aa  277  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  33.96 
 
 
470 aa  272  9e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  38.05 
 
 
490 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  36.03 
 
 
501 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  36.03 
 
 
501 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  36.13 
 
 
470 aa  266  8.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  33.54 
 
 
467 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  33.54 
 
 
475 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  33.54 
 
 
475 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  33.33 
 
 
475 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  34.51 
 
 
477 aa  262  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  34.51 
 
 
477 aa  262  8e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  34.51 
 
 
477 aa  262  8e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  34.51 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  35.08 
 
 
470 aa  262  8.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  34.51 
 
 
477 aa  262  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  34.51 
 
 
477 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  33.54 
 
 
494 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  35.92 
 
 
490 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  35.64 
 
 
489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  34.89 
 
 
527 aa  252  9.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  34.85 
 
 
478 aa  252  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  31.49 
 
 
479 aa  250  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  35.85 
 
 
490 aa  248  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  34.16 
 
 
475 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  30.83 
 
 
471 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  33.19 
 
 
473 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  36.65 
 
 
414 aa  226  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  32.68 
 
 
469 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  31.1 
 
 
495 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  26.99 
 
 
507 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  27.46 
 
 
493 aa  123  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  25.16 
 
 
517 aa  123  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  25.16 
 
 
517 aa  123  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  24.95 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  26.44 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  26.11 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  25.36 
 
 
510 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  26.18 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  27.78 
 
 
526 aa  110  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  26.53 
 
 
491 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  28.98 
 
 
505 aa  98.2  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  25.82 
 
 
552 aa  91.7  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  25.41 
 
 
470 aa  87  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  24.19 
 
 
533 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  22.08 
 
 
514 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  24.11 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  24.55 
 
 
568 aa  82.8  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  23.86 
 
 
491 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  28.01 
 
 
451 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  24.41 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  23.35 
 
 
536 aa  80.1  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  23.28 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  22.92 
 
 
516 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  24.06 
 
 
543 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  24.03 
 
 
486 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  22.53 
 
 
485 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  25 
 
 
618 aa  74.3  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  25.25 
 
 
531 aa  73.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  44.05 
 
 
111 aa  73.6  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  23.54 
 
 
532 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>