More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0348 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  100 
 
 
518 aa  1013    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  87.85 
 
 
517 aa  809    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  87.85 
 
 
517 aa  809    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  63.22 
 
 
489 aa  594  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  55.3 
 
 
526 aa  521  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  48.17 
 
 
510 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  48.35 
 
 
507 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  49.17 
 
 
478 aa  450  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  45.82 
 
 
505 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  47.22 
 
 
451 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  30.69 
 
 
491 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  27.29 
 
 
489 aa  186  7e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  29.09 
 
 
493 aa  176  6e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  28.08 
 
 
491 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  27.16 
 
 
514 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  26.92 
 
 
516 aa  156  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  25.88 
 
 
476 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  25.88 
 
 
476 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  25.54 
 
 
473 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  24.57 
 
 
476 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  25.44 
 
 
482 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  25.25 
 
 
446 aa  139  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  27.35 
 
 
459 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  24.75 
 
 
607 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  26.07 
 
 
520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  26.07 
 
 
520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  25.47 
 
 
470 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  24.85 
 
 
475 aa  133  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  24.86 
 
 
501 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  26.16 
 
 
502 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  25.47 
 
 
532 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  25.32 
 
 
531 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  24.42 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  26.12 
 
 
483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  24.79 
 
 
568 aa  129  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  23.79 
 
 
533 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  26.83 
 
 
460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  28.07 
 
 
502 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  23.4 
 
 
498 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  25.32 
 
 
536 aa  126  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  25.71 
 
 
552 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  24.91 
 
 
543 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  24.48 
 
 
531 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  24.69 
 
 
534 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  24.76 
 
 
485 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  24.84 
 
 
618 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  25.09 
 
 
517 aa  124  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  24.49 
 
 
534 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  24.34 
 
 
487 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  24.49 
 
 
534 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  24.34 
 
 
476 aa  123  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  24.75 
 
 
487 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  24.24 
 
 
487 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  24.24 
 
 
487 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  24.24 
 
 
476 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  24.24 
 
 
487 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  24.24 
 
 
487 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  24.24 
 
 
487 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  24.54 
 
 
487 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  24.24 
 
 
487 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  25.82 
 
 
566 aa  121  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  24.67 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  26.43 
 
 
483 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  23.81 
 
 
483 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  28.44 
 
 
491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  25.05 
 
 
492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  24.34 
 
 
487 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  25.09 
 
 
660 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  23.05 
 
 
483 aa  120  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  25.15 
 
 
452 aa  120  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  29.29 
 
 
477 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  29.04 
 
 
477 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  23.83 
 
 
557 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  29.04 
 
 
477 aa  118  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  26.73 
 
 
502 aa  118  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  25.16 
 
 
455 aa  118  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  29.04 
 
 
477 aa  118  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  25.97 
 
 
475 aa  117  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  27.45 
 
 
477 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  25.97 
 
 
475 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  24.53 
 
 
516 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  25.97 
 
 
475 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  24.9 
 
 
487 aa  117  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  28.79 
 
 
477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  23.94 
 
 
540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  25.61 
 
 
522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  23.62 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  25.45 
 
 
453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  25.53 
 
 
501 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  26.67 
 
 
466 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  24.04 
 
 
501 aa  113  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  24.04 
 
 
501 aa  113  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  28.64 
 
 
506 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  27.44 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  26.85 
 
 
513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  24.53 
 
 
466 aa  111  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  25 
 
 
486 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  26.94 
 
 
487 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  26.94 
 
 
487 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  26.94 
 
 
487 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>