214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_4122 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  99.79 
 
 		 475 aa  937    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  99.79 
 
 		 475 aa  937    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  100 
 
 		 475 aa  938    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  52.41 
 
 		 477 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  52.41 
 
 		 477 aa  485  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  52.2 
 
 		 477 aa  485  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  52.2 
 
 		 477 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  52.2 
 
 		 477 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  52.2 
 
 		 477 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  39.46 
 
 		 492 aa  333  5e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  38.72 
 
 		 466 aa  323  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  38.24 
 
 		 469 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  37.17 
 
 		 517 aa  308  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  35.86 
 
 		 470 aa  293  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  38.63 
 
 		 501 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  36.82 
 
 		 488 aa  291  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  39.3 
 
 		 490 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  37.73 
 
 		 494 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  36.84 
 
 		 476 aa  282  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  37.45 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  35.15 
 
 		 467 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  34.74 
 
 		 470 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  36.76 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  37.74 
 
 		 489 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  36.48 
 
 		 469 aa  273  6e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  34.95 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  33.76 
 
 		 475 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  35.55 
 
 		 490 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  38.4 
 
 		 501 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  36.17 
 
 		 472 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  36.17 
 
 		 472 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  36.4 
 
 		 501 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  36.4 
 
 		 501 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  34.58 
 
 		 484 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  34.38 
 
 		 484 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  34.16 
 
 		 484 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  33.26 
 
 		 487 aa  256  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  33.26 
 
 		 487 aa  256  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  33.26 
 
 		 487 aa  256  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  33.26 
 
 		 487 aa  256  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  33.26 
 
 		 487 aa  256  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  33.26 
 
 		 487 aa  256  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  33.26 
 
 		 487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  33.26 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  33.06 
 
 		 487 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  35.26 
 
 		 473 aa  254  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  34.7 
 
 		 487 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  32.85 
 
 		 487 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  33.33 
 
 		 476 aa  249  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  33.12 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  33.33 
 
 		 473 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  33.33 
 
 		 483 aa  246  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  32.99 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  31.83 
 
 		 502 aa  237  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  32.92 
 
 		 487 aa  236  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  32.52 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  32.52 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  32.72 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  32.72 
 
 		 487 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  32.52 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  32.72 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  32.52 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  32.51 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  35.26 
 
 		 414 aa  228  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  35.03 
 
 		 481 aa  226  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  35.15 
 
 		 506 aa  223  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  33.12 
 
 		 479 aa  216  8e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  32.1 
 
 		 495 aa  207  5e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  33.19 
 
 		 527 aa  203  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  27.27 
 
 		 493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  26.75 
 
 		 507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  27.45 
 
 		 517 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  27.45 
 
 		 517 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  27.09 
 
 		 510 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  26.85 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  26.68 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  24.38 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  25.85 
 
 		 526 aa  100  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  22.94 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  20.56 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  25.67 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0089  2-oxoglutarate/malate translocator  42.73 
 
 		 116 aa  87  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  24.87 
 
 		 489 aa  86.7  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  25.21 
 
 		 482 aa  86.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  22.96 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  23.36 
 
 		 531 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2586  inner membrane protein YbhI  43.56 
 
 		 103 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  23.69 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  26.1 
 
 		 505 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  24.27 
 
 		 514 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  25.57 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  26.2 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  26.04 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  24.52 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  23.84 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  22.98 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  46.75 
 
 		 111 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  25.9 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  26.91 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  23.28 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>