More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2963 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  100 
 
 		 540 aa  1038    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  46.5 
 
 		 552 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  45.3 
 
 		 660 aa  402  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  45.85 
 
 		 566 aa  399  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  45.45 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  45.38 
 
 		 490 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  47.07 
 
 		 531 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  45.65 
 
 		 607 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  52.75 
 
 		 502 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  47.53 
 
 		 486 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  45.91 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  47.26 
 
 		 533 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  44.72 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  49.35 
 
 		 487 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  46.07 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  41.18 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  44.16 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  40.88 
 
 		 522 aa  363  3e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  48.33 
 
 		 517 aa  361  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  43.9 
 
 		 520 aa  360  4e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  43.9 
 
 		 520 aa  360  4e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  46.18 
 
 		 491 aa  354  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  41.51 
 
 		 509 aa  349  7e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  44.02 
 
 		 493 aa  335  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  49.13 
 
 		 481 aa  329  6e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  45.49 
 
 		 486 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  40.93 
 
 		 513 aa  322  8e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  46.65 
 
 		 485 aa  312  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  40.39 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  37.11 
 
 		 572 aa  299  7e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  44.83 
 
 		 495 aa  296  9e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  43.21 
 
 		 596 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  39.96 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  38.79 
 
 		 478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  40.67 
 
 		 522 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  42.31 
 
 		 509 aa  281  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  38.64 
 
 		 467 aa  280  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  38.19 
 
 		 536 aa  279  9e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  38.91 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  36.76 
 
 		 499 aa  246  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  33.33 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  35.86 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  35.46 
 
 		 456 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  31.89 
 
 		 531 aa  226  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  34.91 
 
 		 457 aa  226  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  36.63 
 
 		 456 aa  223  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  34.51 
 
 		 453 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  33.79 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  33.62 
 
 		 463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  32.72 
 
 		 487 aa  219  7e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  32.31 
 
 		 466 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  32.31 
 
 		 466 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  32.31 
 
 		 466 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  32.31 
 
 		 466 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  33.01 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  34.9 
 
 		 534 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  33.62 
 
 		 466 aa  217  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  32.18 
 
 		 447 aa  217  5e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  34.71 
 
 		 534 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  34.71 
 
 		 534 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  34.48 
 
 		 482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  31.78 
 
 		 465 aa  213  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  32.84 
 
 		 464 aa  213  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  31.88 
 
 		 467 aa  213  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  32.61 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  31.88 
 
 		 467 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  33.76 
 
 		 456 aa  210  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  32.53 
 
 		 473 aa  210  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  32.95 
 
 		 543 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  32.34 
 
 		 474 aa  208  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  34.27 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  35.26 
 
 		 462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  30.3 
 
 		 467 aa  187  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  30.29 
 
 		 487 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  35.96 
 
 		 459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  35.74 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  30.12 
 
 		 454 aa  177  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  32.82 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  31.6 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  31.24 
 
 		 476 aa  166  9e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  31.07 
 
 		 472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  30.36 
 
 		 474 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  27.54 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  25.64 
 
 		 516 aa  156  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  36.85 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  26.1 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  31.04 
 
 		 471 aa  153  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  28 
 
 		 482 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  29.38 
 
 		 491 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  29.2 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  26.47 
 
 		 482 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  28.82 
 
 		 478 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  29.22 
 
 		 482 aa  147  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  28.51 
 
 		 471 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  26.92 
 
 		 498 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  25.59 
 
 		 483 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  28.92 
 
 		 482 aa  144  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  25.37 
 
 		 446 aa  143  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  32.25 
 
 		 579 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  30.16 
 
 		 570 aa  140  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>