238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0363 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 532 aa  1073    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  83.97 
 
 		 533 aa  914    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  57.35 
 
 		 568 aa  609  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  41.87 
 
 		 521 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  30.86 
 
 		 489 aa  256  8e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  31.77 
 
 		 493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  26.56 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  25.97 
 
 		 507 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  25.32 
 
 		 478 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  23.4 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  24.63 
 
 		 489 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  26.54 
 
 		 517 aa  124  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  25.17 
 
 		 482 aa  124  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  26.54 
 
 		 517 aa  124  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  26.81 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  26.32 
 
 		 516 aa  120  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  24.36 
 
 		 491 aa  117  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  22.22 
 
 		 476 aa  114  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  22.27 
 
 		 476 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  22.27 
 
 		 476 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  22.27 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  24.48 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  25.82 
 
 		 531 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  20.94 
 
 		 514 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  26.67 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  26.51 
 
 		 517 aa  101  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  23.66 
 
 		 660 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  25.2 
 
 		 517 aa  100  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  24.67 
 
 		 485 aa  100  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  24.47 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  25.85 
 
 		 557 aa  99.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  24.28 
 
 		 475 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  24.26 
 
 		 607 aa  97.8  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  24.05 
 
 		 505 aa  97.4  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  25.46 
 
 		 446 aa  97.1  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  22.48 
 
 		 451 aa  97.1  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  24.77 
 
 		 422 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  24.19 
 
 		 466 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  25.11 
 
 		 506 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  22.22 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  29.77 
 
 		 534 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  24.65 
 
 		 461 aa  92  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  29.77 
 
 		 534 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  29.77 
 
 		 534 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  24.68 
 
 		 491 aa  91.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  25.46 
 
 		 486 aa  91.3  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  28.21 
 
 		 473 aa  91.3  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  27.11 
 
 		 475 aa  90.5  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  23.33 
 
 		 526 aa  90.1  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  24.66 
 
 		 422 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  24.66 
 
 		 422 aa  90.1  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  24.66 
 
 		 422 aa  90.1  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  25.21 
 
 		 520 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  24.02 
 
 		 492 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  23.94 
 
 		 491 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  22.84 
 
 		 483 aa  90.1  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  25.21 
 
 		 520 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  24.66 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  26.67 
 
 		 543 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  30.27 
 
 		 473 aa  88.2  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  25.11 
 
 		 566 aa  88.2  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  22.22 
 
 		 483 aa  88.2  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  23.02 
 
 		 483 aa  86.7  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  28.14 
 
 		 472 aa  86.7  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  28.14 
 
 		 472 aa  86.7  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  23.01 
 
 		 552 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  23.53 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  23.02 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  25.5 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  26.12 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  26.06 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  25.32 
 
 		 470 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  25.41 
 
 		 501 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  23.78 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  23.52 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  24.63 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  23.35 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  21.41 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  23.46 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  25.4 
 
 		 533 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  25.85 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  22.17 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  23.88 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  28.12 
 
 		 555 aa  80.1  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  23.23 
 
 		 463 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  26.14 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  22.42 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0794  sodium/sulphate symporter  27.53 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000496756  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  23.49 
 
 		 618 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  22.97 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  22.92 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  23.64 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1872  sodium/sulphate symporter  24.35 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  24.55 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  22.54 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  25.24 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  23.83 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  24.03 
 
 		 534 aa  77  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4931  sodium/sulphate symporter  25.27 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  23.18 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>