169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0938 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  100 
 
 
492 aa  972    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  66.53 
 
 
488 aa  659    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  68.34 
 
 
489 aa  630  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  64.12 
 
 
490 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  63.88 
 
 
490 aa  587  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  57.82 
 
 
501 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  60.75 
 
 
490 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  58.44 
 
 
501 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  58.44 
 
 
501 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  59.05 
 
 
501 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  52.82 
 
 
494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  48.1 
 
 
517 aa  441  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  50 
 
 
476 aa  440  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  46.65 
 
 
472 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  46.65 
 
 
472 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  47.1 
 
 
473 aa  421  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  44.75 
 
 
472 aa  411  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  45.49 
 
 
466 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  45.23 
 
 
470 aa  411  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  45.7 
 
 
467 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  44.19 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  44.61 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  43.4 
 
 
470 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  43.61 
 
 
470 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  42.86 
 
 
484 aa  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  41.32 
 
 
478 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  46.58 
 
 
414 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  39.33 
 
 
479 aa  347  2e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  41.33 
 
 
471 aa  344  2e-93  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  40.88 
 
 
475 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  39.46 
 
 
475 aa  333  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  39.46 
 
 
475 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  39.46 
 
 
475 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  37.5 
 
 
469 aa  311  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  36.1 
 
 
527 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  37.01 
 
 
477 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  36.8 
 
 
477 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  37.01 
 
 
477 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  37.01 
 
 
477 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  37.01 
 
 
477 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  37.01 
 
 
477 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  38.76 
 
 
473 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  34.59 
 
 
495 aa  289  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  33.7 
 
 
476 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  33.7 
 
 
476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  36 
 
 
483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  33.7 
 
 
487 aa  267  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  33.7 
 
 
487 aa  267  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  33.7 
 
 
487 aa  267  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  33.7 
 
 
487 aa  267  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  33.7 
 
 
487 aa  267  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  33.7 
 
 
487 aa  267  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  35.32 
 
 
487 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  32.37 
 
 
487 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  35.44 
 
 
502 aa  261  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  32.9 
 
 
487 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  32.9 
 
 
487 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  32.46 
 
 
487 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  33.67 
 
 
487 aa  256  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  33.47 
 
 
487 aa  256  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  33.47 
 
 
487 aa  256  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  33.67 
 
 
487 aa  256  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  33.67 
 
 
487 aa  256  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  33.47 
 
 
487 aa  256  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  33.47 
 
 
487 aa  256  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  33.67 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  34.31 
 
 
481 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  37 
 
 
506 aa  248  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  32.99 
 
 
469 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0089  2-oxoglutarate/malate translocator  61.74 
 
 
116 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  27.54 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  25.46 
 
 
489 aa  127  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  65.91 
 
 
111 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  29.26 
 
 
493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  26.17 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  26.17 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  25.36 
 
 
518 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  24.78 
 
 
459 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  29.47 
 
 
568 aa  98.6  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  24.02 
 
 
532 aa  89.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  23.68 
 
 
533 aa  87.8  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  26.32 
 
 
507 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  24.6 
 
 
531 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  26.3 
 
 
451 aa  84  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  22.03 
 
 
482 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  23.46 
 
 
514 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  23.3 
 
 
536 aa  80.1  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  25.99 
 
 
526 aa  79.7  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  27.43 
 
 
505 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  25.08 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  27.15 
 
 
485 aa  75.1  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  24.79 
 
 
491 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  29.02 
 
 
516 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  25.57 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  24.15 
 
 
510 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  23.86 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  25.5 
 
 
486 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  26.67 
 
 
499 aa  68.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  23.08 
 
 
491 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  22.47 
 
 
483 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>