117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2340 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  78.43 
 
 		 462 aa  715    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  79.3 
 
 		 462 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  78.87 
 
 		 462 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  98.92 
 
 		 463 aa  891    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  82.9 
 
 		 463 aa  759    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 463 aa  899    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  98.27 
 
 		 463 aa  885    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  97.19 
 
 		 463 aa  858    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  41.41 
 
 		 530 aa  342  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  41.69 
 
 		 433 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  42.49 
 
 		 432 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  40.8 
 
 		 441 aa  319  7e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  38.5 
 
 		 478 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  40.7 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  38 
 
 		 434 aa  306  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  39.86 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  39.32 
 
 		 502 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  40.38 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  40.38 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  38.16 
 
 		 486 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  38.43 
 
 		 486 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  31 
 
 		 465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  31 
 
 		 465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  27.04 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  25.65 
 
 		 476 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  25.86 
 
 		 485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  26.13 
 
 		 476 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  26.13 
 
 		 476 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  26.19 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  25.06 
 
 		 507 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  26.47 
 
 		 493 aa  87.8  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  22.39 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  27.91 
 
 		 555 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  23.35 
 
 		 532 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  21.75 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  26.97 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  22.83 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  23.62 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  23.62 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  21.03 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  24.32 
 
 		 568 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  24.47 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  21.94 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  25.59 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  24.18 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  24.58 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  20.05 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  22.66 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  21.31 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  21.31 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  24.9 
 
 		 516 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  25.17 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  23.95 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  24.44 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  25.26 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  25.18 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  19.94 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  25.32 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  24.71 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  24.71 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  24.71 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  25.52 
 
 		 531 aa  57  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  22.83 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  20.24 
 
 		 486 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  21.43 
 
 		 465 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  25.09 
 
 		 495 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  21.69 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  25.21 
 
 		 466 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  23.63 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  25.54 
 
 		 499 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  23.29 
 
 		 486 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  22.92 
 
 		 422 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  20.07 
 
 		 470 aa  53.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  24.08 
 
 		 517 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  21.11 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  23.81 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  24.31 
 
 		 536 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  24.88 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  25.81 
 
 		 660 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  21.95 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  22.46 
 
 		 452 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4931  sodium/sulphate symporter  25.43 
 
 		 486 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  21.72 
 
 		 458 aa  50.1  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  24.19 
 
 		 607 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  23.19 
 
 		 491 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  24.54 
 
 		 619 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  29.53 
 
 		 502 aa  50.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  29.38 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  21.93 
 
 		 552 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  23.78 
 
 		 475 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  23.78 
 
 		 475 aa  48.5  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  25.09 
 
 		 484 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  25.76 
 
 		 482 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  23.53 
 
 		 487 aa  47.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  24.49 
 
 		 483 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  23.45 
 
 		 475 aa  47.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  30.69 
 
 		 490 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  23.79 
 
 		 526 aa  47  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  23.87 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  22.65 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>