100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4275 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  94.56 
 
 		 441 aa  793    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  94.78 
 
 		 441 aa  780    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 441 aa  852    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  65.51 
 
 		 433 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  51.08 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  51.54 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  51.33 
 
 		 433 aa  362  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  50.35 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  41.22 
 
 		 462 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  40.75 
 
 		 462 aa  325  9e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  41.22 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  40.8 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  40.7 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  40.47 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  40.7 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  38.41 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  43.67 
 
 		 502 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  41.15 
 
 		 530 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  38.86 
 
 		 478 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  43.1 
 
 		 486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  44.23 
 
 		 486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  37.02 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  36.96 
 
 		 465 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  25.64 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  22.61 
 
 		 485 aa  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  25.23 
 
 		 493 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  29.3 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  21.78 
 
 		 486 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  23.1 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  28.51 
 
 		 510 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  23.79 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  28.51 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  20.23 
 
 		 533 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  25.87 
 
 		 489 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  23.49 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  23.49 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  24.83 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  26.69 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1416  sodium/sulphate symporter  27.51 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  26.2 
 
 		 517 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  23.02 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  26.2 
 
 		 517 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  22.58 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  27.01 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  25.26 
 
 		 491 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  30.25 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  20.55 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  22.88 
 
 		 521 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  24.01 
 
 		 466 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  26.33 
 
 		 505 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  24.78 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  24.78 
 
 		 472 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  24.78 
 
 		 472 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  26.18 
 
 		 517 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  25.49 
 
 		 451 aa  54.3  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  29.33 
 
 		 501 aa  53.5  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  27.96 
 
 		 501 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  34.45 
 
 		 482 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  26.76 
 
 		 499 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  28.28 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  26.82 
 
 		 516 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  33.88 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  28.28 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  28.28 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  27.97 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  26.09 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  26.09 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  24.62 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  24.6 
 
 		 466 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  28.09 
 
 		 526 aa  51.6  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  33.33 
 
 		 482 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  25.4 
 
 		 491 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  28.51 
 
 		 483 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  25.47 
 
 		 488 aa  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  29.75 
 
 		 490 aa  50.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  20.23 
 
 		 568 aa  49.7  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  25.54 
 
 		 487 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  30.95 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  25.09 
 
 		 470 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  25.54 
 
 		 487 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4931  sodium/sulphate symporter  26.27 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  25.54 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  25.54 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  25.54 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  25.52 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  25.09 
 
 		 470 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  25.54 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  25.54 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  25.54 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  20.58 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  25.11 
 
 		 492 aa  47.4  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  20.51 
 
 		 461 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  23.47 
 
 		 447 aa  47  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  22.07 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  24.87 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  24.88 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  21.98 
 
 		 470 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  25.11 
 
 		 475 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  31.82 
 
 		 475 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  26.17 
 
 		 487 aa  43.5  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>