53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1204 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  100 
 
 		 461 aa  922    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  28.5 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  27.82 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  27.6 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  26.29 
 
 		 485 aa  89.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  25.49 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  23.97 
 
 		 502 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  21.2 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  22.65 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  22.92 
 
 		 568 aa  64.3  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  21.86 
 
 		 530 aa  63.9  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  23.2 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  20.09 
 
 		 533 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  21.11 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  23.59 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  19.19 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  21.11 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  20.84 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  25.59 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  26.3 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  23.53 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  22.66 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  19.43 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  31.82 
 
 		 486 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  20.32 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  23.1 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  23.77 
 
 		 517 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  23.77 
 
 		 517 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  21.37 
 
 		 514 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  23.76 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  20.51 
 
 		 532 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  19.58 
 
 		 462 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  20.51 
 
 		 441 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  19.2 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  22.09 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  21.96 
 
 		 491 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  22.2 
 
 		 518 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  23.6 
 
 		 478 aa  50.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  21.16 
 
 		 486 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  23.6 
 
 		 510 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  25 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  21.39 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  21.39 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  22.87 
 
 		 534 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  24.25 
 
 		 448 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  20.06 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  25.29 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  24.58 
 
 		 557 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  25.61 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  25.41 
 
 		 509 aa  43.9  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  23.23 
 
 		 540 aa  43.5  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  19.95 
 
 		 489 aa  43.5  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  35.23 
 
 		 481 aa  43.1  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>