146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2672 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 486 aa  969    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  31.39 
 
 		 470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  28.54 
 
 		 466 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  26.72 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  27.29 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  23.78 
 
 		 502 aa  114  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  23.87 
 
 		 493 aa  87.4  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  25.33 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  25.42 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  23.13 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  21.41 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  23.82 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  22.48 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  20.92 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  20.92 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  21.78 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  22 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  24.88 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  20.74 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  23.09 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  21.34 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  21.56 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  22.93 
 
 		 516 aa  73.6  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  21.41 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  24 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  22.69 
 
 		 517 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  22.69 
 
 		 517 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0794  sodium/sulphate symporter  26.2 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000496756  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  21.04 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  22.92 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  25.43 
 
 		 482 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  20.97 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  25.33 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  22.4 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  22.09 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  22.92 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  22.92 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  22.6 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  22.92 
 
 		 475 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  21.67 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  20.96 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  19.78 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  20.45 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  19.57 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  21.73 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  24.91 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  23.58 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  24.67 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  21.53 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  18.75 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  21.83 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  24.76 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  24.19 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  24.83 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  21.79 
 
 		 526 aa  59.3  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  25.57 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  21.95 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  21.95 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  21.95 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  21.95 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  20.33 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  21.95 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  21.95 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  21.95 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  18.96 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  23.85 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  23.26 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  22.9 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  23.67 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  21.76 
 
 		 453 aa  57  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  23.74 
 
 		 531 aa  57  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  20.24 
 
 		 463 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  22.38 
 
 		 494 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  20.61 
 
 		 498 aa  57  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  21.15 
 
 		 517 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  23.86 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  20.24 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  19.84 
 
 		 532 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  24.32 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  20.28 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  23.24 
 
 		 487 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  22.3 
 
 		 486 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  21.11 
 
 		 459 aa  54.7  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  26.56 
 
 		 488 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  20.24 
 
 		 534 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  22.82 
 
 		 481 aa  54.3  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  21.53 
 
 		 477 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  23.24 
 
 		 487 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  21.53 
 
 		 477 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  21.53 
 
 		 477 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  21.53 
 
 		 477 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  22.29 
 
 		 487 aa  53.9  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  23.24 
 
 		 487 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  21.72 
 
 		 483 aa  53.5  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  23.04 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  20.4 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  21.25 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  23.04 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  23.24 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  20.4 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>