117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3599 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 441 aa  850    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  94.56 
 
 		 441 aa  809    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  99.09 
 
 		 441 aa  843    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  65.58 
 
 		 433 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  49.16 
 
 		 434 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  51.54 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  49.27 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  49.42 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  41.26 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  40.33 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  41.03 
 
 		 462 aa  323  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  40.55 
 
 		 463 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  40.32 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  39.86 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  40.09 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  38.64 
 
 		 463 aa  300  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  41.15 
 
 		 530 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  42.53 
 
 		 502 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  38.24 
 
 		 478 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  43.99 
 
 		 486 aa  273  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  42.37 
 
 		 486 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  35.97 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  35.91 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  25.35 
 
 		 463 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  23.12 
 
 		 485 aa  90.5  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  23.46 
 
 		 493 aa  89  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  23.1 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  22.91 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  26.74 
 
 		 507 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  23.38 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  23.38 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  23.1 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  23.76 
 
 		 473 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  23.1 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  26.1 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1416  sodium/sulphate symporter  28.93 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  27.27 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  22.07 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  25.09 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  27.27 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  19.65 
 
 		 533 aa  60.1  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  25.16 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  24.23 
 
 		 472 aa  57  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  24.88 
 
 		 489 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  26.47 
 
 		 518 aa  56.6  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  24.8 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  25.4 
 
 		 517 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  25.4 
 
 		 517 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  22.68 
 
 		 516 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  31.44 
 
 		 555 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  23.89 
 
 		 472 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  23.89 
 
 		 472 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  25.62 
 
 		 499 aa  53.9  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  25.9 
 
 		 487 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  35.29 
 
 		 482 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  25.9 
 
 		 487 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  24.42 
 
 		 516 aa  53.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  26.01 
 
 		 517 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  27.85 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  25.47 
 
 		 568 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  25.9 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  27.14 
 
 		 501 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  25.9 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  28.3 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  34.85 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  25.9 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  25.9 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  25.9 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  25.9 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  31.3 
 
 		 483 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4931  sodium/sulphate symporter  27.61 
 
 		 486 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  33.88 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  26.57 
 
 		 501 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  26.57 
 
 		 501 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  29.25 
 
 		 607 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  26.29 
 
 		 488 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  21.38 
 
 		 459 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  26.33 
 
 		 475 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  31.75 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  28 
 
 		 490 aa  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  24.65 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  24.13 
 
 		 505 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  19.53 
 
 		 532 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  20.67 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  26.27 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  24.65 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  28.93 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  28.28 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  28.28 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  28.28 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  22.84 
 
 		 473 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  23.69 
 
 		 466 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  20.63 
 
 		 461 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  22.78 
 
 		 483 aa  47  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  22.32 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  22.32 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  23.28 
 
 		 490 aa  46.6  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  21.69 
 
 		 521 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  22.32 
 
 		 477 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  22.2 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>