155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43990 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  100 
 
 
432 aa  827    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  73.62 
 
 
433 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  73.56 
 
 
433 aa  545  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  63.48 
 
 
434 aa  529  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  51.54 
 
 
441 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  52.22 
 
 
433 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  51.31 
 
 
441 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  51.07 
 
 
441 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  42.96 
 
 
462 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  42.29 
 
 
463 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  42.06 
 
 
463 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  42.49 
 
 
463 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  42.06 
 
 
463 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  42.35 
 
 
462 aa  339  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  45.67 
 
 
530 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  43.19 
 
 
462 aa  332  6e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  39.67 
 
 
463 aa  327  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  43.32 
 
 
502 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  36.73 
 
 
478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  44.18 
 
 
486 aa  280  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  43.87 
 
 
486 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  38.24 
 
 
465 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  37.88 
 
 
465 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  31.82 
 
 
463 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  25.19 
 
 
473 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  26.15 
 
 
476 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  26.15 
 
 
476 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  26.58 
 
 
493 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  25.39 
 
 
476 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  21.88 
 
 
533 aa  89  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  28.32 
 
 
489 aa  87  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  24.65 
 
 
485 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  21.41 
 
 
532 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  22.61 
 
 
486 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  26.67 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  23.21 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  29.02 
 
 
555 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  25.52 
 
 
491 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  23.95 
 
 
507 aa  67.4  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  25.1 
 
 
459 aa  66.6  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  28.63 
 
 
466 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  23.13 
 
 
461 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  24.75 
 
 
510 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  23.04 
 
 
478 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  27.2 
 
 
487 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  27.2 
 
 
487 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  27.2 
 
 
487 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  24.42 
 
 
461 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  27.2 
 
 
487 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  23.99 
 
 
514 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  27.27 
 
 
487 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  27.2 
 
 
487 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  27.2 
 
 
487 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  27.2 
 
 
487 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  25.21 
 
 
466 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  23.48 
 
 
447 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  23.39 
 
 
458 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  23.08 
 
 
475 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  24.42 
 
 
489 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  20.55 
 
 
568 aa  56.6  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  28.41 
 
 
446 aa  56.6  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  24.51 
 
 
487 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  24.31 
 
 
477 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  24.31 
 
 
477 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  24.31 
 
 
477 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  24.31 
 
 
477 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  24.31 
 
 
477 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  24.31 
 
 
477 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  24.71 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  24.71 
 
 
422 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  24.71 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1872  sodium/sulphate symporter  24.42 
 
 
461 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  22.68 
 
 
475 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  22.68 
 
 
475 aa  54.7  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  22.73 
 
 
475 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  25.64 
 
 
486 aa  53.9  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  22.27 
 
 
463 aa  54.3  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  21.81 
 
 
464 aa  54.3  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  23.82 
 
 
449 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  24.68 
 
 
451 aa  53.5  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  24.42 
 
 
422 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  23.76 
 
 
518 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  35 
 
 
616 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4931  sodium/sulphate symporter  25.06 
 
 
486 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  24.27 
 
 
422 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  24.73 
 
 
516 aa  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  26.79 
 
 
481 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  28.25 
 
 
605 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  24.94 
 
 
487 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  24.94 
 
 
487 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  25.34 
 
 
466 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  20.37 
 
 
466 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  24.94 
 
 
476 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  24.94 
 
 
487 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  24.36 
 
 
499 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  24.94 
 
 
487 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  24.94 
 
 
487 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  24.25 
 
 
536 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  24.94 
 
 
487 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  25.12 
 
 
476 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>