114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6317 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 433 aa  814    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  86.34 
 
 		 433 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  73.62 
 
 		 432 aa  548  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  57.78 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  52.9 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  51.21 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  49.03 
 
 		 441 aa  361  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  49.03 
 
 		 441 aa  348  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  45.5 
 
 		 530 aa  322  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  40.38 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  39.86 
 
 		 463 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  39.48 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  39.72 
 
 		 462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  39.48 
 
 		 463 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  39.44 
 
 		 462 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  40.38 
 
 		 462 aa  299  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  37.35 
 
 		 463 aa  292  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  42.31 
 
 		 502 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  35.18 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  41.57 
 
 		 486 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  40.33 
 
 		 486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  37.41 
 
 		 465 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  37.32 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  30.68 
 
 		 463 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  24.6 
 
 		 493 aa  87  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  31.69 
 
 		 555 aa  82.8  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  24.27 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  23.86 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  23.8 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  26.97 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  23.86 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  23.86 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  22.92 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  25.24 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  25.25 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  22.54 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  22.15 
 
 		 533 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  25.79 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  22.4 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  25 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  25 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  25 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  23.81 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  23.81 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  23.81 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  23.81 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  23.93 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  24 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  23.02 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  25.98 
 
 		 491 aa  59.7  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  23.02 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  23.02 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  23.02 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  23.02 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0892  anion transporter  25.12 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0801  anion transporter  25.12 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0860  anion transporter  25.12 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.918843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  20.71 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1872  sodium/sulphate symporter  25.6 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0829  anion transporter  25.12 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  23.23 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  20.89 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  27.5 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  22.79 
 
 		 477 aa  57  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  24.43 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  26.67 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  27.31 
 
 		 486 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  25.47 
 
 		 478 aa  53.9  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  23.38 
 
 		 521 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  23.11 
 
 		 459 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  23.76 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  26.74 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  23.23 
 
 		 475 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  21.63 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  24.14 
 
 		 471 aa  49.3  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  24.4 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  26.09 
 
 		 594 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  25.35 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  25.35 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  30.35 
 
 		 534 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  25.98 
 
 		 499 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  30.35 
 
 		 534 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  31.17 
 
 		 605 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  30.35 
 
 		 534 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  24.65 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  24.65 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  24.65 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  24.65 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  24.65 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  21.32 
 
 		 568 aa  47.4  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  27.16 
 
 		 495 aa  47.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  31.52 
 
 		 616 aa  46.6  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  32.56 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  22.65 
 
 		 607 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  25.6 
 
 		 517 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  27.23 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  19.73 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  19.73 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  24.3 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  20.7 
 
 		 518 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>