231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1851 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  100 
 
 
521 aa  1056    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  41.54 
 
 
568 aa  411  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  40.87 
 
 
533 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  41.87 
 
 
532 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  29.56 
 
 
489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  30.82 
 
 
493 aa  183  7e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  27.83 
 
 
491 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  25.37 
 
 
507 aa  124  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  24.83 
 
 
486 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  27.4 
 
 
509 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  25.79 
 
 
505 aa  101  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  25.59 
 
 
518 aa  100  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  23.31 
 
 
510 aa  100  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  25.31 
 
 
531 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  22.93 
 
 
516 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  24.03 
 
 
491 aa  99  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  23.31 
 
 
478 aa  96.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  23.34 
 
 
517 aa  95.9  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  23.34 
 
 
517 aa  95.9  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  23.46 
 
 
552 aa  91.3  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  25.17 
 
 
557 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  26.29 
 
 
543 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  25.06 
 
 
491 aa  89  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  24.68 
 
 
485 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  25.25 
 
 
476 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  23.54 
 
 
520 aa  88.6  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  23.54 
 
 
520 aa  88.6  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  24.84 
 
 
451 aa  87.8  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  24.78 
 
 
482 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  25.08 
 
 
476 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  25.08 
 
 
476 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  26.62 
 
 
506 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  23.53 
 
 
514 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  21.96 
 
 
483 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  23.98 
 
 
473 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  24.42 
 
 
466 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  23.54 
 
 
470 aa  85.9  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  23.8 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  30.04 
 
 
495 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  24.38 
 
 
509 aa  85.1  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  26.46 
 
 
526 aa  84.7  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  25.66 
 
 
607 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  24.89 
 
 
486 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  23.08 
 
 
490 aa  84  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  30.08 
 
 
485 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  23.44 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  24.67 
 
 
487 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  29.15 
 
 
502 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  23.26 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  21.96 
 
 
489 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  26.56 
 
 
517 aa  80.1  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  23.08 
 
 
491 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  24.77 
 
 
498 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  23.86 
 
 
533 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  22.88 
 
 
482 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  23.76 
 
 
511 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  25.63 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  22.09 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  24.64 
 
 
534 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  24.47 
 
 
466 aa  77  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  23.84 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  24.39 
 
 
470 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  23.77 
 
 
493 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  24.81 
 
 
534 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  23.66 
 
 
456 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  25.27 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  23.16 
 
 
534 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  23.16 
 
 
534 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  24.39 
 
 
470 aa  74.7  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  24.42 
 
 
422 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  24.42 
 
 
422 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  24.42 
 
 
422 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  23.6 
 
 
540 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  24.29 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  23.04 
 
 
422 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  25.39 
 
 
473 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  23.18 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  25.16 
 
 
484 aa  70.5  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  24.35 
 
 
475 aa  70.1  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  24.64 
 
 
470 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  25.06 
 
 
531 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  25.32 
 
 
484 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  23.33 
 
 
487 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  23.75 
 
 
487 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  23.31 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  23.75 
 
 
487 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  23.33 
 
 
487 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  26.23 
 
 
469 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  23.1 
 
 
517 aa  68.6  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  19 
 
 
483 aa  68.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  23.79 
 
 
492 aa  68.2  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  24.82 
 
 
468 aa  67  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  24.29 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  24.29 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  23.26 
 
 
618 aa  67  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  22.97 
 
 
473 aa  67  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  23.5 
 
 
466 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  23.5 
 
 
466 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  23.54 
 
 
457 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  22 
 
 
487 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>