246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1490 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  100 
 
 
466 aa  930    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  45.06 
 
 
472 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  45.06 
 
 
472 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  45.49 
 
 
492 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  45.06 
 
 
470 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  44.52 
 
 
472 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  44.61 
 
 
517 aa  419  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  45.41 
 
 
473 aa  412  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  44.44 
 
 
488 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  44.57 
 
 
467 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  44.42 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  44.07 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  43.2 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  43.78 
 
 
470 aa  405  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  45.28 
 
 
489 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  42.86 
 
 
475 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  44.37 
 
 
490 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  43.56 
 
 
473 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  43.32 
 
 
471 aa  373  1e-102  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  41.93 
 
 
490 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  43.31 
 
 
490 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  39.78 
 
 
501 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  41.35 
 
 
484 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  40.88 
 
 
484 aa  351  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  39.37 
 
 
484 aa  350  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  41.15 
 
 
501 aa  343  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  44.69 
 
 
414 aa  341  1e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  38.68 
 
 
477 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  38.68 
 
 
477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  38.68 
 
 
477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  38.68 
 
 
477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  38.68 
 
 
477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  38.94 
 
 
475 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  38.68 
 
 
477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  38.94 
 
 
475 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  39.46 
 
 
479 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  38.72 
 
 
475 aa  336  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  39.64 
 
 
527 aa  333  3e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  39.7 
 
 
501 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  39.7 
 
 
501 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  38.7 
 
 
469 aa  323  4e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  38.54 
 
 
478 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  38.67 
 
 
487 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  38.51 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  38.67 
 
 
487 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  38.46 
 
 
487 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  38.46 
 
 
487 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  37.63 
 
 
487 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  37.63 
 
 
487 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  37.63 
 
 
487 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  37.63 
 
 
487 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  37.63 
 
 
487 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  37.63 
 
 
487 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  37.87 
 
 
476 aa  300  5e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  35.78 
 
 
469 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  34.23 
 
 
495 aa  293  4e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  37.23 
 
 
481 aa  289  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  38.24 
 
 
502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  35.77 
 
 
483 aa  283  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  37.32 
 
 
487 aa  283  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  37.56 
 
 
506 aa  276  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  35.24 
 
 
487 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  35.03 
 
 
487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  35.03 
 
 
487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  35.03 
 
 
487 aa  270  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  35.03 
 
 
487 aa  270  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  35.03 
 
 
487 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  35.03 
 
 
487 aa  270  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  35.03 
 
 
487 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  29.07 
 
 
493 aa  166  8e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  27.58 
 
 
491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  26.01 
 
 
489 aa  117  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  24.84 
 
 
533 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  27.38 
 
 
470 aa  106  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  26.59 
 
 
485 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  29.14 
 
 
518 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  27.67 
 
 
486 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  22.25 
 
 
482 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  26.19 
 
 
517 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  26.19 
 
 
517 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  24.05 
 
 
459 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  25.43 
 
 
516 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0089  2-oxoglutarate/malate translocator  38.39 
 
 
116 aa  97.4  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  24.4 
 
 
514 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  25.66 
 
 
536 aa  94.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  24.02 
 
 
532 aa  93.6  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  22.93 
 
 
482 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  26.03 
 
 
568 aa  91.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  19.69 
 
 
452 aa  85.9  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  23.92 
 
 
502 aa  83.2  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  22.83 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  25.06 
 
 
507 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  25.12 
 
 
522 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  22.44 
 
 
483 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  50.62 
 
 
111 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  25.23 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  24.42 
 
 
521 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  21.79 
 
 
483 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  28.74 
 
 
505 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  24.93 
 
 
476 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>