164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3771 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  97.93 
 
 		 484 aa  933    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  100 
 
 		 484 aa  959    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  89.67 
 
 		 484 aa  867    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  52.75 
 
 		 478 aa  503  1e-141  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  48.09 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  48.33 
 
 		 488 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  45.65 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  45.91 
 
 		 494 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  47.54 
 
 		 473 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  44.19 
 
 		 492 aa  402  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  43.12 
 
 		 517 aa  398  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  44.4 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  45.21 
 
 		 490 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  44.76 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  44.76 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  45.47 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  42.04 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  43.9 
 
 		 501 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  41.83 
 
 		 470 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  44.61 
 
 		 490 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  44.03 
 
 		 489 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  44.38 
 
 		 490 aa  361  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  41.35 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  42.77 
 
 		 501 aa  351  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  42.15 
 
 		 501 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  42.15 
 
 		 501 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  36.4 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  42.04 
 
 		 471 aa  323  3e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  40.48 
 
 		 527 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  42.38 
 
 		 414 aa  311  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  40 
 
 		 469 aa  298  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  36.93 
 
 		 473 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  36.79 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  35.51 
 
 		 495 aa  278  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  36.52 
 
 		 477 aa  276  5e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  36.52 
 
 		 477 aa  276  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  36.52 
 
 		 477 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  36.52 
 
 		 477 aa  276  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  36.31 
 
 		 477 aa  276  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  36.6 
 
 		 477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  37.85 
 
 		 481 aa  269  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  35.99 
 
 		 483 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  34.04 
 
 		 487 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  34.04 
 
 		 487 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  34.04 
 
 		 487 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  33.83 
 
 		 487 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  34.58 
 
 		 475 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  34.58 
 
 		 475 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  34.38 
 
 		 475 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  37.87 
 
 		 502 aa  264  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  35.28 
 
 		 476 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  33.76 
 
 		 487 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  33.76 
 
 		 487 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  33.76 
 
 		 487 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  33.76 
 
 		 487 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  33.76 
 
 		 487 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  34.36 
 
 		 487 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  33.76 
 
 		 487 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  34.61 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  34.21 
 
 		 487 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  34.21 
 
 		 487 aa  252  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  34.21 
 
 		 487 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  34.21 
 
 		 487 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  34.21 
 
 		 487 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  34 
 
 		 487 aa  251  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  34 
 
 		 487 aa  251  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  33.8 
 
 		 487 aa  250  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  36.07 
 
 		 506 aa  230  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  30.33 
 
 		 469 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  25.87 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  56.1 
 
 		 111 aa  100  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  26.61 
 
 		 478 aa  100  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  25.53 
 
 		 518 aa  99  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  26.15 
 
 		 510 aa  99  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0089  2-oxoglutarate/malate translocator  39.45 
 
 		 116 aa  96.7  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  24.7 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  23.13 
 
 		 489 aa  95.1  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  24.01 
 
 		 517 aa  93.2  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  24.01 
 
 		 517 aa  93.2  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  28.77 
 
 		 507 aa  89  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  25.51 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  22.98 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  26.49 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  26.25 
 
 		 566 aa  79  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  26.83 
 
 		 534 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  26.83 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  26.83 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  25.38 
 
 		 607 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  23.67 
 
 		 531 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  28.25 
 
 		 526 aa  74.7  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  22.9 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  22.6 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  28.24 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  25.84 
 
 		 552 aa  73.2  0.000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  23.74 
 
 		 568 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  23.46 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  25.11 
 
 		 543 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  23.39 
 
 		 532 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  26.84 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  25.9 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>