More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3548 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  100 
 
 		 422 aa  827    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  99.76 
 
 		 422 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  99.53 
 
 		 422 aa  822    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  95.02 
 
 		 422 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  100 
 
 		 422 aa  827    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0892  anion transporter  41.59 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0860  anion transporter  41.59 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.918843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0829  anion transporter  41.36 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0801  anion transporter  41.36 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  40.81 
 
 		 447 aa  295  7e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  40.19 
 
 		 449 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  37.86 
 
 		 448 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  39.05 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2656  anion transporter  38.61 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000561885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1523  citrate transporter  38.57 
 
 		 446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1152  citrate transporter  40.05 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0812794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  31.52 
 
 		 482 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  40.51 
 
 		 609 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  41.24 
 
 		 612 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  37.02 
 
 		 621 aa  139  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  27.82 
 
 		 456 aa  139  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  27.62 
 
 		 482 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  27.42 
 
 		 456 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  27.88 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  27.63 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3428  citrate transporter  27.43 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.253129  normal  0.494299 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  28.61 
 
 		 460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1498  di- and tricarboxylate transporters-like  26.1 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  26.9 
 
 		 464 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  27.34 
 
 		 465 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  29.22 
 
 		 474 aa  136  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  38 
 
 		 619 aa  136  8e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  27.42 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  26.29 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  27.25 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  26.79 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  37.26 
 
 		 611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  26.79 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  26.79 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  26.79 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  36.49 
 
 		 613 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  28.03 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  28.03 
 
 		 467 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5235  citrate transporter  25.48 
 
 		 435 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.524079 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  28.54 
 
 		 473 aa  132  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  38.65 
 
 		 609 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  37.11 
 
 		 600 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  28.03 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  28.41 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  27 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  27.78 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  37.31 
 
 		 611 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  40.1 
 
 		 609 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  35.15 
 
 		 588 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  35.98 
 
 		 619 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  36.06 
 
 		 610 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  35.05 
 
 		 630 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0405  di- and tricarboxylate transporters-like  24.77 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  34.58 
 
 		 610 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  35.05 
 
 		 610 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  35.05 
 
 		 610 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  37.62 
 
 		 608 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  37.62 
 
 		 608 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  37.62 
 
 		 608 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  37.62 
 
 		 608 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  38.16 
 
 		 609 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  39.78 
 
 		 610 aa  126  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  37.62 
 
 		 608 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  38.16 
 
 		 609 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  39.11 
 
 		 581 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  36.55 
 
 		 609 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  38.16 
 
 		 609 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  35.5 
 
 		 607 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  39 
 
 		 596 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  35.92 
 
 		 616 aa  123  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  36.95 
 
 		 610 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  36.95 
 
 		 610 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  36.95 
 
 		 610 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  36.95 
 
 		 610 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  36.95 
 
 		 610 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  36.95 
 
 		 610 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  36.06 
 
 		 627 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  36.95 
 
 		 610 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  25.76 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  36.45 
 
 		 610 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  26.27 
 
 		 457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  35.09 
 
 		 604 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  37.2 
 
 		 610 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  23.4 
 
 		 459 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  36.71 
 
 		 610 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  28.67 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  36.45 
 
 		 610 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  26.14 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  24.64 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  34.88 
 
 		 588 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  36.42 
 
 		 612 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  24.87 
 
 		 482 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  31.88 
 
 		 599 aa  116  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  35.15 
 
 		 593 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  26.7 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>