More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0326 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  100 
 
 
491 aa  970    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0794  sodium/sulphate symporter  71.31 
 
 
490 aa  699    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000496756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  59.33 
 
 
483 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  51.67 
 
 
482 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  30.47 
 
 
446 aa  170  5e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  28.25 
 
 
459 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  28.28 
 
 
482 aa  156  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  28.73 
 
 
482 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  28.26 
 
 
483 aa  154  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  28.25 
 
 
483 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  27.39 
 
 
452 aa  148  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  25.24 
 
 
531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  27.72 
 
 
475 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  29.05 
 
 
534 aa  140  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  26.47 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  26.47 
 
 
466 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  23.97 
 
 
522 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  26.47 
 
 
466 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  27.82 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  26.26 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  26.49 
 
 
498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  25.06 
 
 
456 aa  131  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  26.88 
 
 
465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  25.11 
 
 
470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  26.27 
 
 
467 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  27.82 
 
 
466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  26.27 
 
 
467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  26.38 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  27.31 
 
 
499 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  25.79 
 
 
607 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  24.14 
 
 
462 aa  124  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  25.97 
 
 
464 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  25.8 
 
 
457 aa  123  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  25.93 
 
 
660 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  25.99 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  26.89 
 
 
464 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  25.97 
 
 
491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  24.18 
 
 
487 aa  120  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  24.72 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  24.75 
 
 
522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  25.95 
 
 
506 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  23.97 
 
 
520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  23.97 
 
 
520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  26.01 
 
 
458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  26.51 
 
 
478 aa  117  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  24.47 
 
 
513 aa  117  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  27.13 
 
 
486 aa  117  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2041  sodium/sulphate symporter  26.47 
 
 
488 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341922  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  23.21 
 
 
455 aa  116  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  29.87 
 
 
518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  27.06 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  26.52 
 
 
557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  23.37 
 
 
531 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  25.16 
 
 
509 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  24.33 
 
 
516 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  25.71 
 
 
514 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  23.62 
 
 
482 aa  113  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  24.9 
 
 
461 aa  113  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  24.74 
 
 
493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  27.53 
 
 
502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  24.94 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  23.95 
 
 
502 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  27.66 
 
 
460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  23.98 
 
 
490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  25.11 
 
 
491 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  22.71 
 
 
572 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  25.4 
 
 
482 aa  110  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  24.39 
 
 
510 aa  110  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  26.26 
 
 
491 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  25.9 
 
 
456 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  24.54 
 
 
478 aa  108  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  27.27 
 
 
517 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  24.2 
 
 
552 aa  105  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  27.27 
 
 
517 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  23.23 
 
 
483 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  25.23 
 
 
456 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  24.56 
 
 
487 aa  104  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  26.23 
 
 
447 aa  104  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  25.31 
 
 
493 aa  103  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  25.99 
 
 
540 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  24.6 
 
 
474 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  24.69 
 
 
566 aa  99.4  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  23.85 
 
 
536 aa  98.2  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1347  response regulator receiver protein  24.62 
 
 
688 aa  98.2  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  28.14 
 
 
526 aa  98.2  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  24.49 
 
 
543 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1872  sodium/sulphate symporter  24.44 
 
 
461 aa  96.7  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  22.56 
 
 
483 aa  96.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  23.86 
 
 
473 aa  96.7  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  25.63 
 
 
517 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  25.57 
 
 
489 aa  94  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  24.94 
 
 
462 aa  93.6  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  24.89 
 
 
534 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  24.89 
 
 
534 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  25.75 
 
 
472 aa  93.2  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  24.89 
 
 
534 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  23.24 
 
 
507 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  25.8 
 
 
487 aa  92  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  23.98 
 
 
618 aa  90.9  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  22.82 
 
 
516 aa  91.3  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>