276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1872 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1872  sodium/sulphate symporter  100 
 
 
461 aa  894    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  81.34 
 
 
461 aa  746    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  33.73 
 
 
470 aa  246  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  30.49 
 
 
459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  30.25 
 
 
498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  30.19 
 
 
482 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  28.94 
 
 
446 aa  157  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  29.59 
 
 
468 aa  142  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  26.09 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  26.73 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  29.26 
 
 
466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  28.32 
 
 
486 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  27.25 
 
 
482 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  26.54 
 
 
490 aa  133  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  27.02 
 
 
482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  26.09 
 
 
452 aa  130  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  24.38 
 
 
516 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  29.24 
 
 
533 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  27.11 
 
 
489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  27.01 
 
 
483 aa  128  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  28.54 
 
 
466 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  28.54 
 
 
466 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  28.54 
 
 
466 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  28.54 
 
 
466 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  28.41 
 
 
517 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  28.92 
 
 
467 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  27.05 
 
 
487 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  26.5 
 
 
502 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  28.48 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  27.66 
 
 
478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  27.8 
 
 
522 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  26.29 
 
 
660 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  25.73 
 
 
509 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  28.23 
 
 
466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  28.7 
 
 
466 aa  120  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  28.27 
 
 
566 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  25.9 
 
 
607 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  26.08 
 
 
557 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  26.74 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  25.11 
 
 
493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  26.39 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  24.14 
 
 
536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  26.39 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  26.39 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  26.69 
 
 
540 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  27.05 
 
 
495 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  26.62 
 
 
486 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  26.6 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  26.37 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  25.76 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  26.42 
 
 
552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  25.32 
 
 
522 aa  111  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  28 
 
 
513 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  26.67 
 
 
456 aa  110  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  26.34 
 
 
531 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  24.62 
 
 
456 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  26.8 
 
 
483 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  25.97 
 
 
493 aa  107  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  26.73 
 
 
455 aa  106  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  25 
 
 
520 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  24.52 
 
 
534 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  25 
 
 
520 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  25.65 
 
 
463 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  25.69 
 
 
482 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  26.52 
 
 
516 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  26.64 
 
 
506 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  25.18 
 
 
456 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  26.65 
 
 
464 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  24.94 
 
 
465 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  25.06 
 
 
464 aa  103  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  24.63 
 
 
487 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  24.52 
 
 
460 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  24.42 
 
 
491 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  25.61 
 
 
453 aa  102  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  23.1 
 
 
475 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  25.78 
 
 
476 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  25.78 
 
 
476 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  28.23 
 
 
502 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  25.81 
 
 
462 aa  99.4  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  24.17 
 
 
457 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  25.47 
 
 
473 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  25.95 
 
 
478 aa  97.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  25.6 
 
 
462 aa  97.1  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  26.15 
 
 
474 aa  97.1  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  25.35 
 
 
568 aa  96.7  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  26.65 
 
 
618 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  24.89 
 
 
491 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  24.69 
 
 
476 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  26.65 
 
 
473 aa  94  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  21.6 
 
 
514 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  25.88 
 
 
482 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  26.53 
 
 
487 aa  91.3  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  23.84 
 
 
478 aa  90.9  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  26.17 
 
 
448 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  24.68 
 
 
596 aa  90.1  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  22.74 
 
 
422 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  26.3 
 
 
472 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  25.06 
 
 
467 aa  89.4  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  22.74 
 
 
422 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  22.74 
 
 
422 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.672339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>