293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2748 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  97.27 
 
 
510 aa  895    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  100 
 
 
478 aa  937    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  51.05 
 
 
507 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  49.58 
 
 
518 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  48.15 
 
 
517 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  49.68 
 
 
489 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  48.15 
 
 
517 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  52.32 
 
 
451 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  47.51 
 
 
526 aa  391  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  43.99 
 
 
505 aa  340  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  31.8 
 
 
491 aa  203  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  29.92 
 
 
514 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  26.2 
 
 
489 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  27.22 
 
 
491 aa  153  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  28.14 
 
 
533 aa  147  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  25.47 
 
 
493 aa  147  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  28.72 
 
 
531 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  25.7 
 
 
532 aa  137  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  26.08 
 
 
482 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  27.66 
 
 
476 aa  134  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  26.57 
 
 
487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  25.98 
 
 
456 aa  131  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  27.27 
 
 
487 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  27.27 
 
 
487 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  27.05 
 
 
487 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  26.86 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  26.86 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  26.82 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  26.93 
 
 
473 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  26.98 
 
 
476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  27.45 
 
 
568 aa  127  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  26.98 
 
 
487 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  26.98 
 
 
487 aa  126  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  26.98 
 
 
487 aa  126  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  26.98 
 
 
487 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  26.98 
 
 
487 aa  126  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  26.98 
 
 
487 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  28.92 
 
 
487 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  26.67 
 
 
463 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  25.99 
 
 
534 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  25.99 
 
 
534 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  25.99 
 
 
534 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  25.71 
 
 
476 aa  120  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  24.47 
 
 
446 aa  120  7e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  26.15 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  25.59 
 
 
466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  24.84 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  25.38 
 
 
483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  25.49 
 
 
455 aa  118  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  23.39 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  27.18 
 
 
456 aa  117  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  26.05 
 
 
566 aa  117  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  27.63 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  24.5 
 
 
498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  25.54 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  28.4 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  25.54 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  25.6 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  25 
 
 
470 aa  115  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  25.67 
 
 
502 aa  115  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  29 
 
 
540 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  25.05 
 
 
457 aa  114  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  25.38 
 
 
466 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  25.7 
 
 
466 aa  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  23.08 
 
 
452 aa  113  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  26.85 
 
 
475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  26.85 
 
 
475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  26.85 
 
 
475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  25.29 
 
 
522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  26.32 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  25.16 
 
 
467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  24.89 
 
 
467 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  27.43 
 
 
522 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  26.11 
 
 
483 aa  110  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  24.94 
 
 
464 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  23.23 
 
 
485 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  26.61 
 
 
484 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  28.54 
 
 
490 aa  108  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  31.33 
 
 
472 aa  107  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  26.02 
 
 
494 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  26.43 
 
 
557 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  23.67 
 
 
516 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  25.4 
 
 
607 aa  107  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  23.97 
 
 
482 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  24.54 
 
 
491 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  24.51 
 
 
453 aa  106  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  27.49 
 
 
517 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  24.13 
 
 
483 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  26.64 
 
 
499 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  28.06 
 
 
552 aa  103  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  27.17 
 
 
484 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  27.35 
 
 
462 aa  103  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  24.95 
 
 
531 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  24.74 
 
 
475 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  24.63 
 
 
536 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  25.83 
 
 
502 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  24.57 
 
 
482 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  25.28 
 
 
660 aa  100  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  25.91 
 
 
543 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  23.38 
 
 
483 aa  100  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>