177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2328 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  100 
 
 		 472 aa  932    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  84.29 
 
 		 472 aa  782    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  65.67 
 
 		 473 aa  641    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  84.29 
 
 		 472 aa  782    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  49.36 
 
 		 479 aa  486  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  52.64 
 
 		 517 aa  483  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  48.28 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  48 
 
 		 476 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  46.75 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  45.92 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  44.75 
 
 		 492 aa  431  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  47.63 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  45.81 
 
 		 470 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  46.01 
 
 		 488 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  44.52 
 
 		 466 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  45.61 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  45.68 
 
 		 484 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  45.47 
 
 		 484 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  45.36 
 
 		 490 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  42.36 
 
 		 489 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  43.25 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  45.39 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  45.35 
 
 		 490 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  48.05 
 
 		 414 aa  364  2e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  40.56 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  41.1 
 
 		 475 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  43.08 
 
 		 478 aa  351  2e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  41.61 
 
 		 527 aa  342  8e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  42.44 
 
 		 473 aa  336  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  39.52 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  39.52 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  39.66 
 
 		 501 aa  322  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  38.18 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  35.86 
 
 		 487 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  35.86 
 
 		 487 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  35.86 
 
 		 487 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  35.86 
 
 		 487 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  36.07 
 
 		 487 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  37.13 
 
 		 487 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  37.13 
 
 		 487 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  35.86 
 
 		 487 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  35.86 
 
 		 487 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  35.86 
 
 		 487 aa  302  9e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  36.82 
 
 		 476 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  36.92 
 
 		 487 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  37.84 
 
 		 483 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  35.73 
 
 		 487 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  35.73 
 
 		 487 aa  299  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  36.71 
 
 		 487 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  35.73 
 
 		 487 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  35.73 
 
 		 487 aa  299  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  35.73 
 
 		 487 aa  299  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  35.73 
 
 		 487 aa  299  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  35.95 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  37.28 
 
 		 495 aa  297  3e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  36.22 
 
 		 477 aa  296  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  36.22 
 
 		 477 aa  296  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  36.22 
 
 		 477 aa  296  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  36.22 
 
 		 477 aa  296  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  36.22 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  36.22 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  38.12 
 
 		 487 aa  292  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  36.97 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  36.97 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  36.76 
 
 		 475 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  37.01 
 
 		 502 aa  289  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  36.56 
 
 		 481 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  36.82 
 
 		 506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  34.86 
 
 		 469 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  26.73 
 
 		 493 aa  123  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  31.33 
 
 		 510 aa  117  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  31.33 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  23.88 
 
 		 459 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  25.24 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  50 
 
 		 111 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  29.76 
 
 		 568 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  28.4 
 
 		 507 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  28.67 
 
 		 517 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  28.67 
 
 		 517 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  30.41 
 
 		 489 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0089  2-oxoglutarate/malate translocator  41.12 
 
 		 116 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  27.53 
 
 		 533 aa  95.5  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  24.73 
 
 		 516 aa  93.2  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  28.93 
 
 		 518 aa  91.7  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  27.15 
 
 		 491 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  23.29 
 
 		 482 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  21.15 
 
 		 482 aa  87  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  27.43 
 
 		 532 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  23.52 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  27.48 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  24.09 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  29.11 
 
 		 526 aa  79.7  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  30.64 
 
 		 505 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  24.32 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  22.48 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  23.4 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  25.42 
 
 		 531 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  24.65 
 
 		 482 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  21.57 
 
 		 536 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  23.37 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>