164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0686 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  100 
 
 
478 aa  946    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  52.87 
 
 
484 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  52.75 
 
 
484 aa  498  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  52.43 
 
 
484 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  43.67 
 
 
476 aa  373  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  42.19 
 
 
467 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  41.32 
 
 
492 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  42.3 
 
 
488 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  44.2 
 
 
517 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  42.94 
 
 
490 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  42.83 
 
 
494 aa  349  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  41.78 
 
 
489 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  40.37 
 
 
490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  37.53 
 
 
470 aa  336  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  42.38 
 
 
473 aa  335  1e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  38.2 
 
 
470 aa  333  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  37.53 
 
 
470 aa  333  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  43.08 
 
 
472 aa  331  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  39.14 
 
 
501 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  42.03 
 
 
472 aa  325  9e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  42.03 
 
 
472 aa  325  9e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  41.77 
 
 
490 aa  325  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  39.27 
 
 
501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  39.35 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  39.35 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  38.54 
 
 
466 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  35.33 
 
 
479 aa  290  6e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  33.75 
 
 
527 aa  276  7e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  38.78 
 
 
471 aa  275  9e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  38.62 
 
 
414 aa  272  9e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  36.15 
 
 
475 aa  266  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  36.18 
 
 
469 aa  265  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  36.06 
 
 
473 aa  259  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  33.76 
 
 
487 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  36.01 
 
 
481 aa  253  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  32.6 
 
 
495 aa  252  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  34.12 
 
 
487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  34.12 
 
 
487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  33.91 
 
 
487 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  33.69 
 
 
487 aa  243  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  33.69 
 
 
487 aa  243  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  33.48 
 
 
476 aa  243  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  33.69 
 
 
487 aa  243  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  33.69 
 
 
487 aa  243  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  33.69 
 
 
476 aa  243  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  33.69 
 
 
487 aa  243  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  33.69 
 
 
487 aa  243  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  33.98 
 
 
483 aa  242  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  33.47 
 
 
487 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  33.47 
 
 
487 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  33.47 
 
 
487 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  33.47 
 
 
487 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  33.47 
 
 
487 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  33.47 
 
 
487 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  33.47 
 
 
487 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  33.69 
 
 
487 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  33.47 
 
 
487 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  34.33 
 
 
502 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  32.51 
 
 
475 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  32.3 
 
 
475 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  32.3 
 
 
475 aa  230  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  36.09 
 
 
506 aa  227  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  31.06 
 
 
477 aa  226  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  33.5 
 
 
477 aa  226  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  33.5 
 
 
477 aa  226  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  33.5 
 
 
477 aa  226  9e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  33.5 
 
 
477 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  33.25 
 
 
477 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  32.97 
 
 
469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  27.63 
 
 
478 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  26.71 
 
 
510 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  52.44 
 
 
111 aa  97.1  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  25.48 
 
 
518 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  25.18 
 
 
517 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  25.18 
 
 
517 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  24.79 
 
 
493 aa  90.5  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  24.31 
 
 
491 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  25.91 
 
 
489 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  24.68 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  25.73 
 
 
526 aa  83.6  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  21.46 
 
 
489 aa  80.9  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0089  2-oxoglutarate/malate translocator  38.53 
 
 
116 aa  80.9  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  22.39 
 
 
607 aa  80.5  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  23.93 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  22.76 
 
 
507 aa  77.4  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  24.88 
 
 
463 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  22.22 
 
 
514 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  23.86 
 
 
482 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  24.14 
 
 
464 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  24.21 
 
 
465 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  20.64 
 
 
533 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  21.18 
 
 
459 aa  70.1  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  23.89 
 
 
462 aa  68.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  22.34 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  24.29 
 
 
505 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  21.98 
 
 
536 aa  67.4  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  23.54 
 
 
482 aa  67  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  19.14 
 
 
452 aa  67  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  22.63 
 
 
464 aa  67  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  22.51 
 
 
456 aa  66.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>