188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1726 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  100 
 
 		 506 aa  980    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  55.74 
 
 		 502 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  55.06 
 
 		 483 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  50.43 
 
 		 476 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  49.48 
 
 		 487 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  49.36 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  49.36 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  49.36 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  49.36 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  49.36 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  49.27 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  50 
 
 		 487 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  49.36 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  49.36 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  49.27 
 
 		 487 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  47.88 
 
 		 487 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  49.68 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  49.68 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  49.68 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  49.68 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  49.46 
 
 		 487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  49.46 
 
 		 487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  49.46 
 
 		 487 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  49.25 
 
 		 487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  49.58 
 
 		 469 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  45.44 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  37.03 
 
 		 472 aa  290  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  37.03 
 
 		 466 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  35.32 
 
 		 517 aa  290  5.0000000000000004e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  38.54 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  36.29 
 
 		 477 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  36.29 
 
 		 477 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  36.29 
 
 		 477 aa  276  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  36.29 
 
 		 477 aa  276  7e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  36.29 
 
 		 477 aa  276  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  37.34 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  35.36 
 
 		 472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  35.36 
 
 		 472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  36.08 
 
 		 477 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  36.76 
 
 		 492 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  38.82 
 
 		 501 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  36.06 
 
 		 473 aa  272  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  37.29 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  35.6 
 
 		 475 aa  269  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  37.37 
 
 		 501 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  37.37 
 
 		 501 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  38.14 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  34.75 
 
 		 476 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  34.98 
 
 		 470 aa  257  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  35.59 
 
 		 494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  35.35 
 
 		 470 aa  252  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  35.12 
 
 		 470 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  35.42 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  36.05 
 
 		 478 aa  251  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  36.46 
 
 		 484 aa  249  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  36.24 
 
 		 484 aa  248  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  35.31 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  35.31 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  35.1 
 
 		 475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  32.91 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  32.98 
 
 		 479 aa  239  6.999999999999999e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  34.96 
 
 		 490 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  34.45 
 
 		 490 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  32.63 
 
 		 527 aa  226  9e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  36.5 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  33.71 
 
 		 471 aa  224  4e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  34.99 
 
 		 489 aa  223  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  31.91 
 
 		 469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  33.03 
 
 		 495 aa  213  7e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  28.64 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  25.41 
 
 		 517 aa  120  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  25.41 
 
 		 517 aa  120  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  27.15 
 
 		 478 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  27 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  27.06 
 
 		 507 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  26.72 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  29.14 
 
 		 489 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  29.82 
 
 		 526 aa  99.8  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  27.54 
 
 		 491 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  29.29 
 
 		 505 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  25.77 
 
 		 459 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  24.84 
 
 		 536 aa  90.5  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  22.22 
 
 		 489 aa  87  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  26.22 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  25.13 
 
 		 516 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  24.8 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  26.63 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  24.44 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  24.44 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  23.67 
 
 		 552 aa  73.9  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  23.7 
 
 		 531 aa  73.6  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  42.11 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  24.29 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  26.01 
 
 		 534 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  23.14 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  25.6 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  25.72 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  25.72 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  26.04 
 
 		 451 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  23.08 
 
 		 533 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>