215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3243 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  98.97 
 
 
487 aa  943    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  99.18 
 
 
487 aa  946    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  99.18 
 
 
487 aa  946    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  99.59 
 
 
487 aa  948    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  98.97 
 
 
487 aa  943    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  99.38 
 
 
487 aa  947    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  99.18 
 
 
487 aa  945    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  100 
 
 
487 aa  953    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  56.14 
 
 
483 aa  528  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  54.26 
 
 
502 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  45.17 
 
 
487 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  45.44 
 
 
487 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  44.8 
 
 
487 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  44.8 
 
 
487 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  45.44 
 
 
487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  44.8 
 
 
487 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  44.8 
 
 
487 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  44.8 
 
 
487 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  45.22 
 
 
487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  44.8 
 
 
487 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  45.3 
 
 
476 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  44.66 
 
 
476 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  43.52 
 
 
487 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  47.39 
 
 
506 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  47.58 
 
 
469 aa  424  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  42.59 
 
 
481 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  36.68 
 
 
472 aa  300  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  36.68 
 
 
472 aa  300  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  35.86 
 
 
472 aa  298  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  36.38 
 
 
501 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  34 
 
 
517 aa  284  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  35.79 
 
 
488 aa  282  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  37.74 
 
 
473 aa  278  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  35.03 
 
 
466 aa  272  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  33.47 
 
 
492 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  34.17 
 
 
477 aa  265  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  34.17 
 
 
477 aa  265  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  36.11 
 
 
501 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  36.11 
 
 
501 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  34.17 
 
 
477 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  34.17 
 
 
477 aa  264  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  34.17 
 
 
477 aa  264  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  34.24 
 
 
467 aa  264  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  35.05 
 
 
490 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  34.17 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  36.36 
 
 
501 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  34.76 
 
 
484 aa  261  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  35.14 
 
 
470 aa  259  8e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  35.55 
 
 
489 aa  259  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  34.3 
 
 
470 aa  256  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  34 
 
 
484 aa  256  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  33.8 
 
 
484 aa  253  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  32.36 
 
 
476 aa  253  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  32.64 
 
 
470 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  32.92 
 
 
475 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  32.92 
 
 
475 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  32.72 
 
 
475 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  33.47 
 
 
478 aa  246  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  32.08 
 
 
494 aa  239  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  33.54 
 
 
490 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  31.97 
 
 
479 aa  236  8e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  33.63 
 
 
490 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  33.7 
 
 
469 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  29.35 
 
 
471 aa  210  5e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  32.77 
 
 
527 aa  208  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  30.28 
 
 
475 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  32.9 
 
 
414 aa  199  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  30.11 
 
 
473 aa  195  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  28.51 
 
 
495 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  28.51 
 
 
493 aa  121  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  26.36 
 
 
536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  26.72 
 
 
507 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  26.83 
 
 
518 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  26.29 
 
 
517 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  26.29 
 
 
517 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  23.48 
 
 
489 aa  97.4  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  27.15 
 
 
505 aa  96.7  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  27.38 
 
 
526 aa  96.7  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  24.95 
 
 
510 aa  93.2  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  25.91 
 
 
489 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  23.11 
 
 
459 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  25 
 
 
478 aa  89  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  25.85 
 
 
514 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  26.67 
 
 
491 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  24.75 
 
 
516 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  23.67 
 
 
568 aa  84  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  25 
 
 
607 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  20.68 
 
 
533 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  23.23 
 
 
486 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  25.22 
 
 
660 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  24.62 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  25.86 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  24.44 
 
 
499 aa  78.2  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  25.85 
 
 
517 aa  75.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  22.87 
 
 
531 aa  75.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  28.83 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  24.83 
 
 
552 aa  73.6  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  22.6 
 
 
491 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  25.75 
 
 
566 aa  72.8  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  24.21 
 
 
470 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>