166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1092 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  89.82 
 
 
501 aa  884    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  100 
 
 
501 aa  992    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  100 
 
 
501 aa  992    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  82.83 
 
 
501 aa  808    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  58.64 
 
 
492 aa  590  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  55.28 
 
 
488 aa  546  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  57.81 
 
 
489 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  53.07 
 
 
490 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  51.75 
 
 
490 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  50.61 
 
 
490 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  44.65 
 
 
517 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  42.4 
 
 
467 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  42.26 
 
 
476 aa  356  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  42.25 
 
 
484 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  41.92 
 
 
470 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  42.4 
 
 
484 aa  352  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  40.29 
 
 
470 aa  350  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  42.18 
 
 
484 aa  349  7e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  41.51 
 
 
470 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  41.01 
 
 
473 aa  347  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  43.5 
 
 
494 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  39.12 
 
 
466 aa  342  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  41.2 
 
 
472 aa  340  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  41.2 
 
 
472 aa  340  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  39.7 
 
 
472 aa  334  3e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  39.06 
 
 
478 aa  326  7e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  40.81 
 
 
414 aa  299  9e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  37.76 
 
 
471 aa  294  2e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  35.84 
 
 
469 aa  282  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  36.73 
 
 
475 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  36.73 
 
 
475 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  36.52 
 
 
475 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  36.72 
 
 
483 aa  276  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  35.32 
 
 
475 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  34.6 
 
 
527 aa  273  7e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  34.16 
 
 
479 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  36.12 
 
 
487 aa  269  8e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  36.12 
 
 
487 aa  269  8e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  36.12 
 
 
487 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  36.12 
 
 
487 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  36.12 
 
 
487 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  34.77 
 
 
487 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  36.12 
 
 
487 aa  266  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  36.12 
 
 
487 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  36.12 
 
 
487 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  34.57 
 
 
476 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  33.95 
 
 
487 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  33.95 
 
 
487 aa  265  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  33.95 
 
 
487 aa  265  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  34.57 
 
 
487 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  33.95 
 
 
487 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  33.95 
 
 
476 aa  265  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  33.95 
 
 
487 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  33.95 
 
 
487 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  34.57 
 
 
487 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  35.53 
 
 
477 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  35.53 
 
 
477 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  35.53 
 
 
477 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  35.53 
 
 
477 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  35.53 
 
 
477 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  34.36 
 
 
487 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  35.32 
 
 
477 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  34.19 
 
 
495 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  34.21 
 
 
502 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  37.34 
 
 
506 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  33.55 
 
 
481 aa  252  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  33.74 
 
 
487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  32.34 
 
 
473 aa  240  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  29.03 
 
 
469 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0089  2-oxoglutarate/malate translocator  51.28 
 
 
116 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  26.53 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  56.82 
 
 
111 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  27.25 
 
 
493 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  24.46 
 
 
518 aa  104  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  27.29 
 
 
507 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  23.6 
 
 
517 aa  100  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  23.6 
 
 
517 aa  100  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  20.83 
 
 
489 aa  90.1  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  21.03 
 
 
459 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  26.21 
 
 
489 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  25.91 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  21.14 
 
 
533 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  25.32 
 
 
516 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  22.03 
 
 
452 aa  79.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  26.64 
 
 
543 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  24.2 
 
 
526 aa  77  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  24.58 
 
 
532 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  24.09 
 
 
568 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  22.75 
 
 
514 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  21.82 
 
 
510 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  23.03 
 
 
566 aa  70.1  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  21.82 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  23.6 
 
 
531 aa  67  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  25.74 
 
 
505 aa  67  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  24.71 
 
 
522 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  24.18 
 
 
607 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  23.62 
 
 
486 aa  63.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  28.24 
 
 
433 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  23.6 
 
 
491 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  26.77 
 
 
456 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>