151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0506 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  100 
 
 		 479 aa  949    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  50.95 
 
 		 473 aa  508  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  50.64 
 
 		 472 aa  481  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  50.64 
 
 		 472 aa  481  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  49.36 
 
 		 472 aa  477  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  40.82 
 
 		 517 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  39.75 
 
 		 492 aa  360  4e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  41.04 
 
 		 476 aa  352  7e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  40.21 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  37.24 
 
 		 484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  36.61 
 
 		 484 aa  340  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  40.54 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  36.4 
 
 		 484 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  38.29 
 
 		 470 aa  335  9e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  39.49 
 
 		 470 aa  335  9e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  38.49 
 
 		 488 aa  332  9e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  37.72 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  39.46 
 
 		 466 aa  331  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  37.45 
 
 		 489 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  36.94 
 
 		 490 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  35.33 
 
 		 478 aa  296  5e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  36.29 
 
 		 527 aa  294  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  35.27 
 
 		 501 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  40.31 
 
 		 414 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  33.68 
 
 		 490 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  37.03 
 
 		 490 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  34.47 
 
 		 487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  34.47 
 
 		 487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  34.47 
 
 		 487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  34.47 
 
 		 487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  34.47 
 
 		 487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  34.47 
 
 		 487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  34.77 
 
 		 471 aa  273  6e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  34.34 
 
 		 475 aa  272  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  34.42 
 
 		 476 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  34.42 
 
 		 476 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  34.39 
 
 		 487 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  34.39 
 
 		 487 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  34.39 
 
 		 487 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  34.39 
 
 		 487 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  34.72 
 
 		 501 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  34.72 
 
 		 501 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  35.04 
 
 		 501 aa  259  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  35.28 
 
 		 473 aa  259  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  33.04 
 
 		 469 aa  253  6e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  33.69 
 
 		 481 aa  247  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  32.47 
 
 		 487 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  33.68 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  33.68 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  33.68 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  33.68 
 
 		 477 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  33.68 
 
 		 477 aa  244  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  32.03 
 
 		 483 aa  243  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  33.68 
 
 		 477 aa  243  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  32.26 
 
 		 502 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  31.97 
 
 		 487 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  31.52 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  32.97 
 
 		 487 aa  237  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  31.97 
 
 		 487 aa  237  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  32.97 
 
 		 487 aa  237  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  32.97 
 
 		 487 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  32.97 
 
 		 487 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  31.97 
 
 		 487 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  31.97 
 
 		 487 aa  236  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  33.11 
 
 		 506 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  32.91 
 
 		 475 aa  226  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  32.7 
 
 		 475 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  32.7 
 
 		 475 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  27.89 
 
 		 469 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  24.94 
 
 		 493 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  23.91 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  28.31 
 
 		 516 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  44.32 
 
 		 111 aa  88.2  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  24.83 
 
 		 568 aa  87.4  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  21.34 
 
 		 489 aa  82.8  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  27.48 
 
 		 517 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  27.48 
 
 		 517 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  25.93 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  26.06 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  27.33 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  22.83 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  24.1 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  26.26 
 
 		 533 aa  77  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  26.6 
 
 		 489 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  25.45 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  22.02 
 
 		 491 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  22.94 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  25.49 
 
 		 532 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  26.46 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  21.71 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  24.91 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  22.58 
 
 		 516 aa  67.8  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  24.92 
 
 		 482 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  26.29 
 
 		 520 aa  67  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  26.29 
 
 		 520 aa  67  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  21.71 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  22.35 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  22.6 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  25.64 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  24.28 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>