171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1465 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  100 
 
 
490 aa  950    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  74.49 
 
 
490 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  68.92 
 
 
490 aa  662    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  63.88 
 
 
492 aa  621  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  65.98 
 
 
488 aa  621  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  66.46 
 
 
489 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  55.7 
 
 
501 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  55.21 
 
 
501 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  55.14 
 
 
501 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  55.14 
 
 
501 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  48.16 
 
 
476 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  47.38 
 
 
517 aa  431  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  47.19 
 
 
467 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  47.87 
 
 
494 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  45.89 
 
 
470 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  44.07 
 
 
484 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  44.37 
 
 
466 aa  385  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  45.76 
 
 
472 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  45.76 
 
 
472 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  44.26 
 
 
484 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  44.38 
 
 
484 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  44.28 
 
 
473 aa  382  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  44.49 
 
 
472 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  43.99 
 
 
471 aa  362  8e-99  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  42.89 
 
 
470 aa  355  8.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  42.89 
 
 
470 aa  353  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  42.12 
 
 
478 aa  345  1e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  46.7 
 
 
414 aa  332  7.000000000000001e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  40.29 
 
 
475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  39.51 
 
 
475 aa  307  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  39.51 
 
 
475 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  38.85 
 
 
473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  39.3 
 
 
475 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  37.65 
 
 
477 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  37.2 
 
 
477 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  37.65 
 
 
477 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  37.65 
 
 
477 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  37.65 
 
 
477 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  37.45 
 
 
477 aa  294  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  36.71 
 
 
479 aa  289  7e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  35.07 
 
 
527 aa  289  8e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  37.05 
 
 
469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  34.8 
 
 
495 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  32.84 
 
 
476 aa  257  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  36.63 
 
 
502 aa  257  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  31.91 
 
 
487 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  31.91 
 
 
487 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  31.91 
 
 
487 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  32.62 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  32.62 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  32.62 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  32.62 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  32.62 
 
 
476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  32.62 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  32.62 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  35.7 
 
 
483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  31.71 
 
 
487 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  33.83 
 
 
487 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  33.83 
 
 
487 aa  247  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  33.83 
 
 
487 aa  247  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  33.83 
 
 
487 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  33.62 
 
 
487 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  33.62 
 
 
487 aa  246  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  33.62 
 
 
487 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  33.62 
 
 
487 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  32.84 
 
 
487 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  32.62 
 
 
481 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  30.6 
 
 
469 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  35.45 
 
 
506 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0089  2-oxoglutarate/malate translocator  52.17 
 
 
116 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  27.67 
 
 
491 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  28.51 
 
 
493 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  60.98 
 
 
111 aa  110  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  26.25 
 
 
518 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  26.02 
 
 
517 aa  104  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  26.02 
 
 
517 aa  104  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  24.59 
 
 
489 aa  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  27.53 
 
 
510 aa  103  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  28.17 
 
 
478 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  28.22 
 
 
507 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  27.43 
 
 
489 aa  91.3  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  29.12 
 
 
505 aa  89.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  22.44 
 
 
533 aa  84  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  26.65 
 
 
516 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  23.63 
 
 
532 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  24.15 
 
 
531 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  23.89 
 
 
526 aa  77.8  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  25.23 
 
 
568 aa  76.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  21.72 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  23.53 
 
 
491 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  25.78 
 
 
552 aa  73.9  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  26.86 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  26.68 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  26.02 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  23.41 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  21.31 
 
 
452 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  22.91 
 
 
482 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  23.86 
 
 
499 aa  64.3  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  25.16 
 
 
482 aa  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  25.9 
 
 
566 aa  63.2  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>