175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1050 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  81.84 
 
 
501 aa  820    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  100 
 
 
501 aa  985    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  82.83 
 
 
501 aa  801    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  82.83 
 
 
501 aa  801    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  59.05 
 
 
492 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  56.61 
 
 
488 aa  553  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  57.64 
 
 
489 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  55.21 
 
 
490 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  52.16 
 
 
490 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  52.67 
 
 
490 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  43.86 
 
 
517 aa  392  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  43.6 
 
 
467 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  41.78 
 
 
484 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  43.76 
 
 
476 aa  365  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  42.77 
 
 
484 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  42.89 
 
 
470 aa  362  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  42.18 
 
 
484 aa  362  8e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  40.87 
 
 
466 aa  362  8e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  41.86 
 
 
470 aa  359  8e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  42.27 
 
 
470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  43.51 
 
 
494 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  39.87 
 
 
473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  39.27 
 
 
478 aa  334  2e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  40.6 
 
 
472 aa  332  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  40.6 
 
 
472 aa  332  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  39.66 
 
 
472 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  39.34 
 
 
471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  41.85 
 
 
414 aa  302  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  38.61 
 
 
475 aa  289  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  38.61 
 
 
475 aa  289  9e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  38.4 
 
 
475 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  36.01 
 
 
527 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  36.38 
 
 
469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  36.71 
 
 
483 aa  280  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  35.23 
 
 
487 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  35.23 
 
 
487 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  35.23 
 
 
487 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  34.72 
 
 
476 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  35.03 
 
 
487 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  36.08 
 
 
502 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  34.07 
 
 
487 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  34.07 
 
 
487 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  34.07 
 
 
487 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  34.07 
 
 
487 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  34.07 
 
 
487 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  34.07 
 
 
487 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  34.62 
 
 
479 aa  266  7e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  34.3 
 
 
476 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  36.36 
 
 
487 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  36.36 
 
 
487 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  36.36 
 
 
487 aa  263  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  36.36 
 
 
487 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  36.36 
 
 
487 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  36.36 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  36.36 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  36.36 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  36.36 
 
 
487 aa  262  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  36.36 
 
 
477 aa  262  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  36.36 
 
 
487 aa  262  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  36.36 
 
 
477 aa  262  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  36.36 
 
 
487 aa  262  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  33.26 
 
 
475 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  36.36 
 
 
477 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  33.26 
 
 
495 aa  261  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  38.91 
 
 
506 aa  259  6e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  35.14 
 
 
487 aa  253  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  33.77 
 
 
481 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  33.4 
 
 
473 aa  249  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  31.12 
 
 
469 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  28.23 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  28.45 
 
 
493 aa  126  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  25.72 
 
 
518 aa  118  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  27.18 
 
 
507 aa  113  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  25.13 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  25.13 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  56.82 
 
 
111 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0089  2-oxoglutarate/malate translocator  44.44 
 
 
116 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  23.19 
 
 
489 aa  101  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  22.41 
 
 
452 aa  94.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  24.65 
 
 
489 aa  90.5  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  26.91 
 
 
516 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  22.36 
 
 
533 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  27.99 
 
 
505 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  26.04 
 
 
526 aa  80.9  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  24.59 
 
 
470 aa  78.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  27.08 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  25.16 
 
 
570 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  21.35 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  25.41 
 
 
568 aa  75.5  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  21.8 
 
 
532 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  22.72 
 
 
514 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  24.8 
 
 
543 aa  73.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  23.27 
 
 
531 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  23.97 
 
 
531 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  24.54 
 
 
522 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  24.43 
 
 
506 aa  68.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  22.47 
 
 
510 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  23.58 
 
 
534 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  22.61 
 
 
607 aa  67  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  25.05 
 
 
491 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>