133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0104 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  74.16 
 
 
494 aa  686    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  100 
 
 
476 aa  944    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  52.07 
 
 
517 aa  481  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  50 
 
 
492 aa  450  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  47.88 
 
 
467 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  47.53 
 
 
488 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  49.02 
 
 
473 aa  429  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  48.74 
 
 
472 aa  425  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  48.74 
 
 
472 aa  425  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  47.57 
 
 
472 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  45.63 
 
 
470 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  49.89 
 
 
490 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  46.48 
 
 
484 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  45.71 
 
 
490 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  45.65 
 
 
484 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  45.65 
 
 
484 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  49.69 
 
 
489 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  48.93 
 
 
490 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  43.59 
 
 
470 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  43.5 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  43.2 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  46.9 
 
 
471 aa  387  1e-106  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  43.67 
 
 
478 aa  386  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  43.91 
 
 
501 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  43.76 
 
 
501 aa  359  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  41.04 
 
 
479 aa  349  6e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  37.95 
 
 
475 aa  344  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  43.33 
 
 
501 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  43.33 
 
 
501 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  43.59 
 
 
414 aa  325  1e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  38.72 
 
 
527 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  36.98 
 
 
469 aa  306  7e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  38.14 
 
 
473 aa  296  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  35.86 
 
 
495 aa  293  6e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  35.94 
 
 
477 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  35.94 
 
 
477 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  35.94 
 
 
477 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  35.94 
 
 
477 aa  286  7e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  35.94 
 
 
477 aa  286  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  35.73 
 
 
477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  36.84 
 
 
475 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  36.63 
 
 
475 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  36.63 
 
 
475 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  36.54 
 
 
481 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  34.24 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  36.58 
 
 
502 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  34.13 
 
 
476 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  33.77 
 
 
487 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  33.77 
 
 
487 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  33.55 
 
 
487 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  33.69 
 
 
476 aa  266  8.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  33.69 
 
 
487 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  33.69 
 
 
487 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  33.69 
 
 
487 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  33.69 
 
 
487 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  33.69 
 
 
487 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  33.69 
 
 
487 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  33.33 
 
 
487 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  35.61 
 
 
487 aa  263  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  34.67 
 
 
469 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  32.36 
 
 
487 aa  249  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  32.15 
 
 
487 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  32.36 
 
 
487 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  32.36 
 
 
487 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  32.15 
 
 
487 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  32.15 
 
 
487 aa  247  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  32.15 
 
 
487 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  32.15 
 
 
487 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  34.82 
 
 
506 aa  237  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  27.02 
 
 
493 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  24.79 
 
 
491 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  25 
 
 
489 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  28.12 
 
 
518 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  26.3 
 
 
517 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  26.3 
 
 
517 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  26.63 
 
 
510 aa  95.5  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  26.77 
 
 
568 aa  94.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  25.12 
 
 
507 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  26.37 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  49.44 
 
 
111 aa  91.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  29.22 
 
 
533 aa  87.4  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0089  2-oxoglutarate/malate translocator  40.78 
 
 
116 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  29.54 
 
 
505 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  26.88 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  24.05 
 
 
470 aa  80.5  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  28.57 
 
 
532 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  22.35 
 
 
459 aa  76.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  26.84 
 
 
526 aa  69.7  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  19.78 
 
 
514 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  24.24 
 
 
482 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  29.11 
 
 
485 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  23.47 
 
 
476 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  24.13 
 
 
531 aa  63.2  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  26.99 
 
 
451 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  25.16 
 
 
521 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  19.52 
 
 
482 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  21.66 
 
 
483 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  25.13 
 
 
516 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  22.79 
 
 
473 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  22.77 
 
 
446 aa  58.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>