172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0370 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  89.67 
 
 
484 aa  868    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  100 
 
 
484 aa  959    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  89.88 
 
 
484 aa  868    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  52.87 
 
 
478 aa  511  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  46.6 
 
 
467 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  46.48 
 
 
476 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  46.38 
 
 
473 aa  414  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  45.28 
 
 
494 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  43.32 
 
 
517 aa  403  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  45.83 
 
 
488 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  42.86 
 
 
492 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  44.23 
 
 
490 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  43.1 
 
 
470 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  45.61 
 
 
472 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  44.26 
 
 
472 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  44.26 
 
 
472 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  41.44 
 
 
470 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  44.03 
 
 
490 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  42.92 
 
 
501 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  40.62 
 
 
470 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  42.83 
 
 
489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  44.44 
 
 
490 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  39.37 
 
 
466 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  42.18 
 
 
501 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  37.24 
 
 
479 aa  342  1e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  41.85 
 
 
501 aa  341  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  41.85 
 
 
501 aa  341  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  39.38 
 
 
471 aa  316  6e-85  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  40.48 
 
 
527 aa  315  9e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  42.12 
 
 
414 aa  313  4.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  39.35 
 
 
469 aa  302  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  35.6 
 
 
495 aa  288  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  37.34 
 
 
473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  35.23 
 
 
475 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  37.69 
 
 
481 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  34.93 
 
 
483 aa  272  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  34.78 
 
 
487 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  34.78 
 
 
487 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  34.78 
 
 
487 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  34.57 
 
 
487 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  34.35 
 
 
476 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  33.96 
 
 
487 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  34.46 
 
 
477 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  33.96 
 
 
487 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  33.96 
 
 
487 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  35.7 
 
 
502 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  34.46 
 
 
477 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  33.96 
 
 
487 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  34.46 
 
 
477 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  33.96 
 
 
487 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  33.96 
 
 
487 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  34.25 
 
 
477 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  34.13 
 
 
476 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  34.46 
 
 
477 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  34.25 
 
 
477 aa  264  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  34.37 
 
 
475 aa  263  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  34.37 
 
 
475 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  34.16 
 
 
475 aa  262  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  34.83 
 
 
487 aa  257  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  34.96 
 
 
487 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  34.83 
 
 
487 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  34.83 
 
 
487 aa  257  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  34.83 
 
 
487 aa  257  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  32.91 
 
 
487 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  34.76 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  34.76 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  34.76 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  34.73 
 
 
506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  31.06 
 
 
469 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  26.61 
 
 
478 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  25.92 
 
 
510 aa  106  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  26.03 
 
 
493 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  54.88 
 
 
111 aa  99.4  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  25.72 
 
 
518 aa  99  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  25.39 
 
 
517 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  25.39 
 
 
517 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0089  2-oxoglutarate/malate translocator  39.45 
 
 
116 aa  93.6  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  24.2 
 
 
489 aa  93.2  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  23.39 
 
 
491 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  24.26 
 
 
482 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  27.03 
 
 
566 aa  87.4  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  24.37 
 
 
482 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  26.24 
 
 
607 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  22.6 
 
 
533 aa  82  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  26.82 
 
 
507 aa  80.5  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  22.44 
 
 
459 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  25.95 
 
 
516 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  24.32 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  26.47 
 
 
568 aa  77  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  23.9 
 
 
483 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  24.27 
 
 
470 aa  77  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  25.17 
 
 
534 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  24.65 
 
 
543 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  25.17 
 
 
534 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  24.42 
 
 
531 aa  75.1  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  25.17 
 
 
534 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  25.72 
 
 
526 aa  74.7  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  26.88 
 
 
486 aa  74.7  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  28.94 
 
 
505 aa  73.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  24.35 
 
 
489 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>