243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0560 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  100 
 
 		 507 aa  992    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  61.06 
 
 		 451 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  52.18 
 
 		 489 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  50.73 
 
 		 510 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  51.05 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  47.53 
 
 		 517 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  47.53 
 
 		 517 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  48.63 
 
 		 518 aa  423  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  50.87 
 
 		 526 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  45.02 
 
 		 505 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  30.82 
 
 		 491 aa  190  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  29.71 
 
 		 493 aa  166  9e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  26.38 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  26.74 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  25.11 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  26.32 
 
 		 514 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  25.97 
 
 		 532 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  28.6 
 
 		 607 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  29.16 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  28.81 
 
 		 487 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  28.81 
 
 		 487 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  28.81 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  26.64 
 
 		 536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  25.87 
 
 		 470 aa  127  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  24.8 
 
 		 516 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  24.69 
 
 		 498 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  26.53 
 
 		 476 aa  123  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  27.57 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  27.57 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  27.57 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  27.57 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  27.57 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  27.57 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  26.99 
 
 		 483 aa  120  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  22 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  22 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  26.88 
 
 		 487 aa  120  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  26.95 
 
 		 475 aa  120  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  26.95 
 
 		 475 aa  120  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  26.25 
 
 		 660 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  26.75 
 
 		 475 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  21.31 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  28.32 
 
 		 540 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  25.87 
 
 		 531 aa  116  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  27.04 
 
 		 476 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  25.71 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  27.02 
 
 		 501 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  25.6 
 
 		 466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  26.98 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  26.65 
 
 		 543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  24.3 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  21.06 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  24.36 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  26.04 
 
 		 463 aa  113  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  26.12 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  24.85 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  25.73 
 
 		 466 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  25.92 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  25.73 
 
 		 466 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  26.12 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  28.8 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  23.72 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  24.03 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  25.98 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  26.12 
 
 		 487 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  23.71 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  25.52 
 
 		 466 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  25.92 
 
 		 487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  25.92 
 
 		 487 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  25.92 
 
 		 487 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  25.92 
 
 		 487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  27.09 
 
 		 502 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  27.7 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  27.6 
 
 		 499 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  25.25 
 
 		 487 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  23.86 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  27.19 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  27.66 
 
 		 502 aa  107  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  24.68 
 
 		 568 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  29.6 
 
 		 477 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  29.28 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  24.1 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  25.41 
 
 		 552 aa  105  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  25.74 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  29.28 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  29.28 
 
 		 477 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  29.28 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  23.38 
 
 		 455 aa  105  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  29.28 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  24.65 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  25.05 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  27.54 
 
 		 490 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  29.59 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  23.91 
 
 		 467 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  26.4 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  24.95 
 
 		 465 aa  103  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  24.32 
 
 		 466 aa  103  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  22.93 
 
 		 520 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  24.68 
 
 		 534 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  23.7 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>