149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0456 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 433 aa  832    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  65.51 
 
 		 441 aa  548  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  65.58 
 
 		 441 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  65.12 
 
 		 441 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  52.22 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  48.43 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  53.16 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  52.42 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  40.97 
 
 		 462 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  41.92 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  40.51 
 
 		 462 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  41.69 
 
 		 463 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  41.69 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  40.98 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  41.2 
 
 		 462 aa  322  6e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  38.14 
 
 		 463 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  41.23 
 
 		 530 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  43.28 
 
 		 502 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  45.04 
 
 		 486 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  37.35 
 
 		 478 aa  282  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  42.86 
 
 		 486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  36.83 
 
 		 465 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  36.77 
 
 		 465 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  27.06 
 
 		 463 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  29.59 
 
 		 507 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  25 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  25.99 
 
 		 466 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  22.91 
 
 		 470 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  21.41 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  27.27 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  22.86 
 
 		 473 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  22.52 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  22.52 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  23.55 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  22.6 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  24.83 
 
 		 491 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  28.76 
 
 		 517 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  28.76 
 
 		 517 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  28.51 
 
 		 518 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  29.29 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  24.66 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  24.66 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  24.66 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  28.13 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  28.13 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  26.96 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  28.57 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  28.13 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  28.13 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  23.33 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  28.39 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  28.13 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  27.08 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  27.2 
 
 		 510 aa  67  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  28.13 
 
 		 487 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  30.27 
 
 		 555 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  26.36 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  22.09 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  24.69 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  24.82 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  27.07 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  26.52 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  29.46 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  24.79 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  26.85 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  26.85 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  22.6 
 
 		 568 aa  57  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  28.09 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  28.37 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  23.59 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  24.28 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  27.97 
 
 		 526 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  24.79 
 
 		 472 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  24.79 
 
 		 472 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  25.93 
 
 		 483 aa  53.5  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  25.82 
 
 		 471 aa  53.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  24.17 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  23.53 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  26.69 
 
 		 475 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  24.84 
 
 		 470 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  26.94 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  26.42 
 
 		 484 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  23.5 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  25.69 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  21.86 
 
 		 470 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  24.84 
 
 		 470 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  26.03 
 
 		 483 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  22.97 
 
 		 464 aa  50.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  33.57 
 
 		 482 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  35.16 
 
 		 490 aa  49.7  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  18.52 
 
 		 533 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  26.21 
 
 		 527 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  24.73 
 
 		 499 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  23.1 
 
 		 521 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  22.38 
 
 		 477 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  21.63 
 
 		 469 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  35.2 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  26.17 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  28.62 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  22.38 
 
 		 477 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>